RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 GRAPQ13588 217 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC158Q5M9N0 1113 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DAAM2Q86T65 1068 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HSCBQ8IWL3 235 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFAF2Q8N183 169 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UCMAQ8WVF2 138 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MAP4K1Q92918 833 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SNX21Q969T3 373 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CHFRQ96EP1 664 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TTPALQ9BTX7 342 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MAGEH1Q9H213 219 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KIF13BQ9NQT8 1826 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UTRNP46939 3433 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CHD4Q14839 1912 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CACNA1SQ13698 1873 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RAMP2O60895 175 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SLC6A2P23975 617 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ATICP31939 592 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 BMPR1AP36894 532 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CTXN1P60606 82 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FSTL1Q12841 308 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 IL10RAQ13651 578 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PLCB4Q15147 1175 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NECTIN1Q15223 517 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RFX8Q6ZV50 586 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FITM2Q8N6M3 262 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NT5C1BQ96P26 610 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CRAMP1Q96RY5 1269 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PADI4Q9UM07 663 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GPR34Q9UPC5 381 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 LAMA4Q16363 1823 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 A0A087X1B8 175 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 UNC119BA6NIH7 251 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SGTAO43765 313 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 MMP10P09238 476 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 HOXC13P31276 330 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ITGA8P53708 1063 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GUCY1B3Q02153 619 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 WASHC5Q12768 1159 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 RESTQ13127 1097 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 PMS2P11Q13670 270 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 PFKFB4Q16877 469 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 FAM205BPQ63HN1 556 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 APOA5Q6Q788 366 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 VRK3Q8IV63 474 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SDF4Q9BRK5 362 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 FSD1Q9BTV5 496 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 LRFN1Q9P244 771 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 AASSQ9UDR5 926 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms