RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522115.6

PTPN12-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 5

Gene PTPN12, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-215	ENST00000522115	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CUL5	Q93034	780 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	VPS16	Q9H269	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PPEF2	O14830	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	INPPL1	O15357	1258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TLR2	O60603	784 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PLAU	P00749	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	FGB	P02675	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CTSA	P10619	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	LMO1	P25800	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	IDUA	P35475	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	MMP13	P45452	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	YPEL5	P62699	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115		Q4G0T1	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	MUL1	Q969V5	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CD63	P08962	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ALAD	P13716	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SERPINB3	P29508	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC8A1	P32418	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ID2	Q02363	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	DMWD	Q09019	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	STARD3	Q14849	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TWIST1	Q15672	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ELF2	Q15723	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	EID2B	Q96D98	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	FAR2	Q96K12	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	NKX2-8	O15522	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	FFAR2	O15552	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	IGFBP2	P18065	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	STAT6	P42226	847 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SOX2	P48431	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	AGTR2	P50052	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	GRM4	Q14833	912 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115		A0A087WV62	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	CER1	O95813	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	TFEB	P19484	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPN12-215	ENST00000522115	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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