RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PRSS44E7EML9 344 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PRYO14603 147 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PRC1O43663 620 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ALPLP05186 524 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 DRD1P21728 446 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 MATN1P21941 496 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 DUSP1P28562 367 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 IDUAP35475 653 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 GAB1Q13480 694 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ERV3-1Q14264 604 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 RIPOR3Q96MK2 946 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 FCRL5Q96RD9 977 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 TM2D2Q9BX73 214 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 TTC3P53804 2025 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CD8B2A6NJW9 211 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 M0QZQ0 153 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 INPPL1O15357 1258 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 OAZ2O95190 189 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PLAUP00749 431 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 MYL3P08590 195 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PRF1P14222 555 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 IDEP14735 1019 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 NDUFS1P28331 727 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ID2Q02363 134 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SEMA3AQ14563 771 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 TWIST1Q15672 202 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 LONRF1Q17RB8 773 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ARL13BQ3SXY8 428 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 MAP9Q49MG5 647 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM209BQ5JX69 171 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ACSM6Q6P461 480 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 RFX6Q8HWS3 928 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 GLMPQ8WWB7 406 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 LYZL4Q96KX0 146 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CTAGE1Q96RT6 745 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CA14Q9ULX7 337 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.88□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 H3BNX3 289 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PCDH17O14917 1159 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CAND2O75155 1236 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 VIPP01282 170 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 MMP8P22894 467 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 RPS6KB1P23443 525 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 YY1P25490 414 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 HOXD12P35452 270 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF84P51523 738 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF91Q05481 1191 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CNGA3Q16281 694 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 MPEG1Q2M385 716 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 LAS2Q8IYD9 372 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ASB12Q8WXK4 309 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 CHST12Q9NRB3 414 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SQORQ9Y6N5 450 aa3.87□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SOX2P48431 317 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 HSPA7P48741 367 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 DMWDQ09019 674 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 SEMA3BQ13214 749 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 BFSP2Q13515 415 aa3.86□□□□□ -1.79
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms