RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 INVSQ9Y283 1065 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CACNA1AO00555 2505 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0A0MRY4 1105 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SGK1O00141 431 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM24O15164 1050 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN3O60637 253 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO21O94952 628 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LTFP02788 710 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KLKB1P03952 638 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RETP07949 1114 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 NCAM1P13591 858 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KRT9P35527 623 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 WASP42768 502 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GPD2P43304 727 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ID4P47928 161 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF132P52740 706 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PTK2Q05397 1052 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SPEM2Q0P670 501 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZNB5 142 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CHPFQ8IZ52 775 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SCML4Q8N228 414 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TERB1Q8NA31 727 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GPT2Q8TD30 523 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 GAB3Q8WWW8 586 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 IRGQQ8WZA9 623 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ACP6Q9NPH0 428 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 RHOBTB1O94844 696 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 NTSR1P30989 418 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SLC11A2P49281 568 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TBX4P57082 545 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ARID5AQ03989 594 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 PASD1Q8IV76 773 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 UCMAQ8WVF2 138 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HMGB4Q8WW32 186 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SYNCQ9H7C4 482 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 EBF1Q9UH73 591 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CEP83Q9Y592 693 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 BECN2A8MW95 431 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 DCLK1O15075 740 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MBD3O95983 291 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CISD3P0C7P0 127 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 HOXB2P14652 356 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 LAMA1P25391 3075 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 SNX16P57768 344 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFB4P59827 614 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MIIPQ5JXC2 388 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRF1Q5T601 910 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 FYB2Q5VWT5 728 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.67□□□□□ -1.02
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PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 STK32AQ8WU08 396 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRM-214ENST00000583153 SHC3Q92529 594 aa8.67□□□□□ -1.02
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