RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 SLC6A11P48066 632 aa28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 MESP2Q0VG99 397 aa28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 LAIR1Q6GTX8 287 aa28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA1958Q8N8K9 716 aa28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 EDEM1Q92611 657 aa28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 HHIPQ96QV1 700 aa28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHB18PQ96TA0 734 aa28.38■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 K7EQS6 105 aa28.37■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 C12orf40Q86WS4 652 aa28.37■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 CEP250Q9BV73 2442 aa28.37■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 GYPCP04921 128 aa28.36■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 ASIC2Q16515 512 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM72Q6ZMU5 477 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 CPLX3Q8WVH0 158 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 CPA5Q8WXQ8 436 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SYT11Q9BT88 431 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 E2F8A0AVK6 867 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 IRF1P10914 325 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 GABRB2P47870 512 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SEC13P55735 322 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 LY6G5CQ5SRR4 150 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP68Q76N32 757 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SYT13Q7L8C5 426 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 MIB1Q86YT6 1006 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 VSTM4Q8IW00 320 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 BBS7Q8IWZ6 715 aa28.35■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 RNF139Q8WU17 664 aa28.35■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa28.35■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 GREM1O60565 184 aa28.34■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 DMC1Q14565 340 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF5Q15542 800 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 C2orf27AQ580R0 203 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 OR6B2Q6IFH4 312 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 MSANTD2Q6P1R3 559 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 OLFML1Q6UWY5 402 aa28.34■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 USP33Q8TEY7 942 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA1Q92805 767 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM149B1Q96BN6 582 aa28.34■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D14Q9P2M4 693 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 RETP07949 1114 aa28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SNX16P57768 344 aa28.33■■■□□ 2.13
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GNPTAB-202ENST00000392919 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 C18orf8Q96DM3 657 aa28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa28.32■■■□□ 2.12
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GNPTAB-202ENST00000392919 ADH5P11766 374 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 CASP14P31944 242 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 C2CD6Q53TS8 623 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 GAB3Q8WWW8 586 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 PNKPQ96T60 521 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM5Q9C035 493 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-202ENST00000392919 HAUS4Q9H6D7 363 aa28.32■■■□□ 2.12
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