RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 HSPA13P48723 471 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 AP3M2P53677 418 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 MYBPC1Q00872 1141 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 APOFQ13790 326 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 VPS72Q15906 364 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 EMC1Q8N766 993 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 CNBD2Q96M20 576 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 PADI4Q9UM07 663 aa20.9■□□□□ 0.94
PPP1CC-201ENST00000335007 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT34O76011 436 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 APRTP07741 180 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 NR1H2P55055 460 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 MMRN1Q13201 1228 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 MCUQ8NE86 351 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP2A3Q93084 1043 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PNPOQ9NVS9 261 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 EMCNQ9ULC0 261 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 FBXO21O94952 628 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ADGRE1Q14246 886 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 FAXCQ5TGI0 409 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 C16orf46Q6P387 395 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SERPINI1Q99574 410 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 STK39Q9UEW8 545 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 APPL1Q9UKG1 709 aa20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC36A6NLP5 189 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNA4P22459 653 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 CDH6P55285 790 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TMED1Q13445 227 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PEX6Q13608 980 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PCLAFQ15004 111 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 NUP93Q8N1F7 819 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC43Q8N309 656 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 JDP2Q8WYK2 163 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SORT1Q99523 831 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 LHX5Q9H2C1 402 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 BTBD7Q9P203 1132 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PLIN3O60664 434 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 EMP3P54852 163 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 CREB5Q02930 508 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF410Q86VK4 478 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.88■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SCN9AQ15858 1988 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 DCXO43602 365 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ENDOD1O94919 500 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNN1Q92952 543 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF195O14628 629 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 MED7O43513 233 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ATG7O95352 703 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBED1O96006 694 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEA3P43357 314 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 MYL6P60660 151 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TGFB2P61812 414 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 XYLT1Q86Y38 959 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR49Q8IV35 697 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHGB4Q9UN71 923 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.87■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 K7ERI5 159 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ZMPSTE24O75844 475 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 PSAPP07602 524 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC5A2P31639 672 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 GALK1P51570 392 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 C4orf22Q6V702 233 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 DEPTORQ8TB45 409 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.86■□□□□ 0.93
PPP1CC-201ENST00000335007 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms