RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SKILP12757 684 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CHRNB2P17787 502 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFAIP3P21580 790 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 BDNFP23560 247 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PON2Q15165 354 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC142Q17RM4 750 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF3Q5VWG9 929 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 STK32AQ8WU08 396 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CYLDQ9NQC7 956 aa24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPRDP23468 1912 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN5O00501 218 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 VNN2O95498 520 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 MMEP08473 750 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 MYL4P12829 197 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GJA1P17302 382 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX16P57768 344 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP4Q13115 394 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PLK5Q496M5 336 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC30AQ86WT1 665 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 DEF6Q9H4E7 631 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ASAH2Q9NR71 780 aa24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CALCAP01258 141 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2F1P24903 491 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G4AP47712 749 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TEAD2Q15562 447 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC20AQ6ZU45 233 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA17Q96L03 361 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC42Q96M95 316 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GZMAP12544 262 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIK1P39086 918 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GPD2P43304 727 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE4CQ08493 712 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 MGAT5BQ3V5L5 792 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 HSFY1Q96LI6 401 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SMOQ99835 787 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 MIS12Q9H081 205 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 EHD2Q9NZN4 543 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 YIPF1Q9Y548 306 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ATG13O75143 517 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ACADSBP45954 432 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ALDH1A3P47895 512 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 NOMO3P69849 1222 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ELF2Q15723 593 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TTC8Q8TAM2 541 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 UBA3Q8TBC4 463 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CHP1Q99653 195 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 COMMD8Q9NX08 183 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-214ENST00000592483 LNP1A1A4G5 178 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 AKR1B10O60218 316 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOBTB1O94844 696 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP3K7CLP57077 242 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CREB5Q02930 508 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CENPCQ03188 943 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TWF1Q12792 350 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 VEPH1Q14D04 833 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC18A3Q16572 532 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PASD1Q8IV76 773 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB3Q9Y575 518 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMA5O15230 3695 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-214ENST00000592483 EML5Q05BV3 1969 aa24.75■■□□□ 1.55
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