RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
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CCNDBP1-211ENST00000567434 APBA1Q02410 837 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.459e-7■■■□□ 15.7
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FYB2Q5VWT5 728 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUGGCQ68CJ6 796 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 C11orf74Q86VG3 221 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 RASSF3Q86WH2 238 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 SFTPA1Q8IWL2 248 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC45BQ8IWX7 931 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC33Q8N5R6 958 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
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