RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.077e-7■■■□□ 16.1
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PTDSS2-201ENST00000308020 DNAJC9Q8WXX5 260 aa21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 VTA1Q9NP79 307 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 MPP5Q8N3R9 675 aa21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 E2F7Q96AV8 911 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 STOML1Q9UBI4 398 aa21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 PPEF2O14830 753 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 METTL18O95568 372 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 RARBP10826 455 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 MROH9Q5TGP6 573 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 ACOT1Q86TX2 421 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 PDHXO00330 501 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 KYAT1Q16773 422 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 TREML1Q86YW5 311 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 NRG4Q8WWG1 115 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 SETD4Q9NVD3 440 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 SNTG2Q9NY99 539 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.72■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 HMX2A2RU54 273 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 CAPN9O14815 690 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 GRIA1P42261 906 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 GBE1Q04446 702 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 RFX8Q6ZV50 586 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC30AQ86WT1 665 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 C7orf26Q96N11 449 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 A6NHS1 94 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 SMPD1P17405 629 aa21.71■■□□□ 1.07
PTDSS2-201ENST00000308020 PGM1P36871 562 aa21.71■■□□□ 1.07
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PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF534Q76KX8 674 aa21.71■■□□□ 1.07
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