RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 E9PBE3 544 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CYP26A1O43174 497 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GRK4P32298 578 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RORBQ92753 470 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CDH7Q9ULB5 785 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 USP6P35125 1406 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PDHBP11177 359 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PAX7P23759 505 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINB5P36952 375 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 IFNEQ86WN2 208 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRT-209ENST00000612229 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRT-209ENST00000612229 NFICP08651 508 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FCER1AP12319 257 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ATP1A4Q13733 1029 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC153Q494R4 210 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KPNA6O60684 536 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CCNB2O95067 398 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ITGA2P17301 1181 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PIDD1Q9HB75 910 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TSC22D2O75157 780 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 DGKIO75912 1065 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GMIPQ9P107 970 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NLRP1Q9C000 1473 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NCAM2O15394 837 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SSNA1O43805 119 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MED24O75448 989 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FASP25445 335 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HSF2Q03933 536 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF394Q53GI3 561 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF6Q58WW2 860 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AMER2Q8N7J2 671 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087X0T9 212 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ATP9BO43861 1147 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 BAIAP3O94812 1187 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-10P10266 1014 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 COMTP21964 271 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RPTNQ6XPR3 784 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRT-209ENST00000612229 FAR1Q8WVX9 515 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SKA1Q96BD8 255 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRT-209ENST00000612229 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 UPB1Q9UBR1 384 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 USP32Q8NFA0 1604 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HOXC6P09630 235 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 IL12AP29459 219 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CAPGP40121 348 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 COPZ1P61923 177 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CYP24A1Q07973 514 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.17□□□□□ -1.26
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