RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 E7ENQ6 273 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 HOXC13P31276 330 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 FNTBP49356 437 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 COG7P83436 770 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SASS6Q6UVJ0 657 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 ACP6Q9NPH0 428 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SLC8A2Q9UPR5 921 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 THAP12O43422 761 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 LILRB5O75023 590 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 GABBR2O75899 941 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 BSPRYQ5W0U4 402 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 TPGS1Q6ZTW0 290 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 EDEM1Q92611 657 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SIX2Q9NPC8 291 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGEF4Q9NR80 690 aa32.21■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 SLC12A8A0AV02 714 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 BECN2A8MW95 431 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 K7EQS6 105 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 MED7O43513 233 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 APODP05090 189 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 GNA15P30679 374 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 DAOAP59103 153 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 MESP2Q0VG99 397 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 TCP11X2Q5H9J9 407 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 DENND1BQ6P3S1 775 aa32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 Q6ZNB5 142 aa32.2■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 RNF139Q8WU17 664 aa32.2■■■□□ 2.75
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CMTM4-204ENST00000563952 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
CMTM4-204ENST00000563952 KAT7O95251 611 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 C2orf27AQ580R0 203 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC183Q5T5S1 534 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SFTPA1Q8IWL2 248 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SCML4Q8N228 414 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC26Q8TAB7 109 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF606Q8WXB4 792 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 HSFY1Q96LI6 401 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 BBS2Q9BXC9 721 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 MIS12Q9H081 205 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ST7Q9NRC1 585 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJC12Q9UKB3 198 aa32.19■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 USP34Q70CQ2 3546 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 KLKB1P03952 638 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 CLEC4CQ8WTT0 213 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SHC3Q92529 594 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ACDQ96AP0 544 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 DCLK3Q9C098 648 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ABCC13Q9NSE7 274 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ANO10Q9NW15 660 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 TAB2Q9NYJ8 693 aa32.18■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ANTXRLA6NF34 631 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 TULP3O75386 442 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 GRIA2P42262 883 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 GPD2P43304 727 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 PXNP49023 591 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
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CMTM4-204ENST00000563952 FMNL3Q8IVF7 1028 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SUMF1Q8NBK3 374 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 USP33Q8TEY7 942 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 IRGQQ8WZA9 623 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 DEC1Q9P2X7 70 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF510Q9Y2H8 683 aa32.17■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 STX1AQ16623 288 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 DENND1CQ8IV53 801 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 GOLGA1Q92805 767 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 BHMTQ93088 406 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 HHIPQ96QV1 700 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 HINFPQ9BQA5 517 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 EPC1Q9H2F5 836 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 WDR35Q9P2L0 1181 aa32.16■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 FBXO21O94952 628 aa32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 TYRP14679 529 aa32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 HOXA6P31267 233 aa32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 DMC1Q14565 340 aa32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SYT13Q7L8C5 426 aa32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 PHTF2Q8N3S3 785 aa32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 PLD4Q96BZ4 506 aa32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
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CMTM4-204ENST00000563952 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 DMDP11532 3685 aa32.14■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 LTFP02788 710 aa32.14■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 KCNMA1Q12791 1236 aa32.14■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 SCUBE3Q8IX30 993 aa32.14■■■□□ 2.74
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC33Q8N5R6 958 aa32.14■■■□□ 2.74
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