RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CLPTM1O96005 669 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MIB1Q86YT6 1006 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SPON1Q9HCB6 807 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TCF7L2Q9NQB0 619 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RRN3Q9NYV6 651 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TPBGLP0DKB5 382 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DPEP1P16444 411 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 OXCT1P55809 520 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 APOPT1Q96IL0 206 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 APOL2Q9BQE5 337 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CLPBQ9H078 707 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 UBDO15205 165 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TGFB3P10600 412 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA9Q13797 1035 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SNTNA6NMZ2 147 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CYTH3O43739 400 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SLITRK3O94933 977 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GLP2RO95838 553 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ITGALP20701 1170 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CNTN1Q12860 1018 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CYP51A1Q16850 503 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GALNTL6Q49A17 601 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.74■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 EGFRP00533 1210 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 IMPDH2P12268 514 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NFIL3Q16649 462 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 THAP1Q9NVV9 213 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 INTS13Q9NVM9 706 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MLNP12872 115 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CASP7P55210 303 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NCALDP61601 193 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CSHL1Q14406 222 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 BBS2Q9BXC9 721 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 VTI1BQ9UEU0 232 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RNF103O00237 685 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FAM153BP0C7A2 387 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CDH17Q12864 832 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FAM153CQ494X1 144 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GRTP1Q5TC63 336 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ERO1BQ86YB8 467 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.73■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 PGM5Q15124 567 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087X0B3 334 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 THP07101 528 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL8P10145 99 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SHMT1P34896 483 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ZPBP2Q6X784 338 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 SATB2Q9UPW6 733 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NR5A2O00482 541 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NR2C2P49116 596 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RAD23AP54725 363 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ACAP1Q15027 740 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FCHO1O14526 889 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 THPOP40225 353 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 RNF180Q86T96 592 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 ASB7Q9H672 318 aa21.72■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 NWD1Q149M9 1564 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM13O60858 407 aa21.71■■□□□ 1.07
CCSAP-201ENST00000284617 VTNP04004 478 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms