RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367367.8

PTPRC-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 2,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-203ENST00000367367 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 INTS13Q9NVM9 706 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 RMND1Q9NWS8 449 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SIX4Q9UIU6 781 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 AGAP1Q9UPQ3 857 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 DERAQ9Y315 318 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-203ENST00000367367 SPAG17Q6Q759 2223 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-203ENST00000367367 BIRC3Q13489 604 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-203ENST00000367367 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-203ENST00000367367 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-203ENST00000367367 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-203ENST00000367367 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.35□□□□□ -1.87
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