RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 EGFP01133 1207 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 RARGP13631 454 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 RGS7P49802 495 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 PDE6CP51160 858 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 SATB1Q01826 763 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 CETN1Q12798 172 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 CPA6Q8N4T0 437 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 TTC39CQ8N584 583 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 CHRDQ9H2X0 955 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 COMMD8Q9NX08 183 aa15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 O00370 1275 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 P4HA2O15460 535 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 GABBR2O75899 941 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 VDRP11473 427 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 KRT5P13647 590 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC6A11P48066 632 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 TKTL1P51854 596 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 MESP2Q0VG99 397 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 CCINQ13939 588 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 ATP2A3Q93084 1043 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 ULBP1Q9BZM6 244 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.09■□□□□ 0.01
TM7SF3-211ENST00000542667 CYP17A1P05093 508 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 HMBSP08397 361 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 LCP1P13796 627 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 TCF3P15923 654 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PFKLP17858 780 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 DMWDQ09019 674 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 GAB4Q2WGN9 574 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 MIB1Q86YT6 1006 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 THAP9Q9H5L6 903 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 USP3Q9Y6I4 520 aa15.08■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM170AA1A519 330 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 M0QYV0 167 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 USP8P40818 1118 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 NBL1P41271 181 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 TUBP50607 506 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF132P52740 706 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 BCAT1P54687 386 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 GCNT1Q02742 428 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 ADIGQ0VDE8 80 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 EFEMP1Q12805 493 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 LRRC32Q14392 662 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 DHCR24Q15392 516 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 RAB41Q5JT25 222 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 MIIPQ5JXC2 388 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PMF1Q6P1K2 205 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 C12orf40Q86WS4 652 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 NAT16Q8N8M0 369 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 MSANTD3Q96H12 275 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 CYLDQ9NQC7 956 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 HESX1Q9UBX0 185 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.07■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 CFAP54Q96N23 3096 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 KCNJ18B7U540 433 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 GREM1O60565 184 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 RNF40O75150 1001 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 NFATC1O95644 943 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 ZBED1O96006 694 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PAEPP09466 180 aa15.06■□□□□ 0
TM7SF3-211ENST00000542667 PON1P27169 355 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms