RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254051.10

TNS4-201, Transcript of tensin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS4, Length 4,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS4-201ENST00000254051 OPHN1O60890 802 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SRGAP2O75044 1071 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 TSPAN9O75954 239 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PIGRP01833 764 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 APOEP02649 317 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PAEPP09466 180 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 MOGSQ13724 837 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 C2CD6Q53TS8 623 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 EFHC2Q5JST6 749 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PNKPQ96T60 521 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 GANQ9H2C0 597 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 GJD2Q9UKL4 321 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 A0A1W2PQY0 241 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CCDC188H7C350 402 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 LCA5LO95447 670 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 GUCY2DQ02846 1103 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 TUSC3Q13454 348 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 BBS5Q8N3I7 341 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SHC3Q92529 594 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 ZFP42Q96MM3 310 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 UROC1Q96N76 676 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 NDNQ99608 321 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SIK2Q9H0K1 926 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PPP1R37O75864 691 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 ATF2P15336 505 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CDH6P55285 790 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 VSNL1P62760 191 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 ITKQ08881 620 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 KRT72Q14CN4 511 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 DCAF6Q58WW2 860 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CASC4Q6P4E1 433 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 TTC13Q8NBP0 860 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 FIZ1Q96SL8 496 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CARD9Q9H257 536 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 ALG6Q9Y672 507 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 RRM1P23921 792 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 DNAJB2P25686 324 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SERPINB3P29508 390 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SULT1E1P49888 294 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 WSCD1Q658N2 575 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 UNC93AQ86WB7 457 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 BBOF1Q8ND07 529 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 APBB2Q92870 758 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CARNS1A5YM72 827 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 EFCAB14O75071 495 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 PRKCIP41743 596 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 C2orf54Q08AI8 447 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 FAM187BQ17R55 369 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 SEMA4DQ92854 862 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 KRT82Q9NSB4 513 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS4-201ENST00000254051 MYADML2A6NDP7 307 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms