RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	GAS4	Q08271	471 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	TRP3	P00937	484 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	LDH1	P38139	375 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	HSE1	P38753	452 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	RRM3	P38766	723 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	AKR1	P39010	764 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	NEO1	P40527	1151 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	LEM3	P42838	414 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	YJL181W	P46987	611 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
SOV1	YMR066W	CYT1	P07143	309 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SRS2	P12954	1174 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	KAP122	P32767	1081 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SIS2	P36024	562 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	YNL108C	P53929	270 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ITT1	Q04638	464 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	FRA1	Q07825	749 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RSB1	Q08417	382 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ISF1	P32488	338 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	DYS1	P38791	387 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SHU2	P38957	223 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	BUD9	P53226	547 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	HDA3	Q06623	655 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	GIC2	Q06648	383 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ADP1	P25371	1049 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SCD5	P34758	872 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	YKL077W	P36081	392 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ATG36	P46983	293 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	HPC2	Q01448	625 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SPO71	Q03868	1245 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
SOV1	YMR066W	LAP2	Q10740	671 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	YLR122C	Q12312	125 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RGP1	P16664	663 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SFA1	P32771	386 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SEG2	P34250	1132 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ISW1	P38144	1129 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SAF1	P38352	637 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	GIP2	P40036	548 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SPO74	P45819	413 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	JJJ2	P46997	583 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RCM1	P53972	490 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	CDC55	Q00362	526 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	PUN1	Q06991	263 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SLP1	Q12232	587 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	TSC13	Q99190	310 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	AI3	P03877	415 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SWI5	P08153	709 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	APM2	P38700	605 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	MMM1	P41800	426 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	STU2	P46675	888 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	GUP1	P53154	560 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	BDF2	Q07442	638 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	PHO87	P25360	923 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	AIM46	P38885	310 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	IOC3	P43596	787 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	CIT3	P43635	486 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	UBA2	P52488	636 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	MCM1	P11746	286 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SMC1	P32908	1225 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SLD2	P34252	453 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SLX8	P40072	274 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	TED1	P40533	473 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	TAF1	P46677	1066 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ENV11	P53246	860 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SQT1	P35184	431 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	UBX7	P38349	436 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	SSN3	P39073	555 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	CTH1	P47976	325 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	ECM23	Q02710	187 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SOV1	YMR066W	YOR223W	Q12015	292 aa		0.55	□□□□□ -2.32

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