RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	AIM7	Q12156	149 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YBL053W	YBL053W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YBL053W	YBL053W	NIT1	P40447	199 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YBL053W	YBL053W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YBL053W	YBL053W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YBL053W	YBL053W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YBL053W	YBL053W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	GIP4	P39732	760 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	TAF1	P46677	1066 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	SLP1	Q12232	587 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	SEA4	P38164	1038 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	SDH1	Q00711	640 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	MRP10	O75012	95 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	MCM1	P11746	286 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	CSE4	P36012	229 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	TED1	P40533	473 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	ECL1	P48235	211 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	SKP1	P52286	194 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	REC8	Q12188	680 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	APM2	P38700	605 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	YNR040W	P53736	256 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	DSE4	P53753	1117 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	DFG16	Q99234	619 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YBL053W	YBL053W	GIP2	P40036	548 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	NTH2	P35172	780 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	YPP1	P46951	817 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	IDI1	P15496	288 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	KAP122	P32767	1081 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	YFL034W	P43564	1073 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	YBL036C	P38197	257 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	YHL008C	P38750	627 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YBL053W	YBL053W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	HDA2	Q06629	674 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	YNR065C	P53751	1116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	CDA2	Q06703	312 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	CYT1	P07143	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	RPC31	P17890	251 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	SCD5	P34758	872 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	THI80	P35202	319 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	YPT53	P36019	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	FLR1	P38124	548 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	YJL181W	P46987	611 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	ITC1	P53125	1264 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	PAN5	P38787	379 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	NCE103	P53615	221 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	MSH6	Q03834	1242 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YBL053W	YBL053W	HSP78	P33416	811 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	QDR2	P40474	542 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	GIC2	Q06648	383 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	NSI1	Q12457	570 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	YNL108C	P53929	270 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	TSC13	Q99190	310 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	RSC2	Q06488	889 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	NFS1	P25374	497 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	LEM3	P42838	414 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	BIO2	P32451	375 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	HXT5	P38695	592 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	MMM1	P41800	426 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	RIM21	P48565	533 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	PPT1	P53043	513 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YBL053W	YBL053W	KIN1	P13185	1064 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	DMA1	P38823	416 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	CIT3	P43635	486 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	GUP1	P53154	560 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	YOR296W	Q08748	1289 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	ELG1	Q12050	791 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	BSD2	P38356	321 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	BRL1	P38770	471 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	RCM1	P53972	490 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YBL053W	YBL053W	YML122C	Q03207	126 aa		3.24	□□□□□ -1.89

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