RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-212ENST00000597259 GDF9O60383 454 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 IFT140Q96RY7 1462 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 HIC1Q14526 733 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 NLRP7Q8WX94 980 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 FAM187AA6NFU0 413 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 POTECB2RU33 542 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 DGAT1O75907 488 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 ABCC8Q09428 1581 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 GPR37O15354 613 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 CUX1P39880 1505 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 SPSB2Q99619 263 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-212ENST00000597259 GNPATO15228 680 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 RDH13Q8NBN7 331 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 WDR97A6NE52 1622 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 ST8SIA5O15466 376 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 FUT2Q10981 343 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 FOXC1Q12948 553 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 MORN1Q5T089 497 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 CHD1O14646 1710 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 THAP11Q96EK4 314 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 PHOX2BQ99453 314 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-212ENST00000597259 AAASQ9NRG9 546 aa9.71□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 SOGA1O94964 1423 aa9.71□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 ATP6V1AP38606 617 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 GCGRP47871 477 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 RPIAP49247 311 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 ARHGEF11O15085 1522 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 DACH1Q9UI36 760 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 PBRM1Q86U86 1689 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 BRICD5Q6PL45 260 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 SYNJ1O43426 1573 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.66□□□□□ -0.86
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HERC3-212ENST00000597259 SULF1Q8IWU6 871 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-212ENST00000597259 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 TOP2BQ02880 1626 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 GRIN2BQ13224 1484 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 CYP4X1Q8N118 509 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 ARAP1Q96P48 1450 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 AVPP01185 164 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 MSS51Q4VC12 460 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 SYNJ2O15056 1496 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-212ENST00000597259 AXIN1O15169 862 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 TREML4Q6UXN2 200 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 CD46P15529 392 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 HLA-CQ95604 372 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 ADAMTS12P58397 1594 aa9.57□□□□□ -0.88
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HERC3-212ENST00000597259 MMP16P51512 607 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 TRIM32Q13049 653 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 WNT7AO00755 349 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 SMPD1P17405 629 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 CEP170Q5SW79 1584 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 KDM4AO75164 1064 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 MAP2K5Q13163 448 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 Q3C1V9 767 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC3-212ENST00000597259 GRIN2AQ12879 1464 aa9.53□□□□□ -0.88
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