RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LILRB3O75022 631 aa9.79□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RDH13Q8NBN7 331 aa9.79□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP4CP60510 307 aa9.78□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.78□□□□□ -0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HRCP23327 699 aa9.77□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.77□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KDM4AO75164 1064 aa9.76□□□□□ -0.85
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.75□□□□□ -0.85
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.74□□□□□ -0.85
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WWC1Q8IX03 1113 aa9.73□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ABL2P42684 1182 aa9.72□□□□□ -0.85
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.72□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.72□□□□□ -0.85
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FDX1P10109 184 aa9.71□□□□□ -0.86
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC10A3P09131 477 aa9.69□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLF2Q8IX21 1173 aa9.69□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POM121CA8CG34 1229 aa9.68□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC4A3P48751 1232 aa9.68□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GUCA2AQ02747 115 aa9.68□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HLA-CQ95604 372 aa9.68□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.68□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 APLP1P51693 650 aa9.67□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.67□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GLMNQ92990 594 aa9.66□□□□□ -0.86
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NECTIN2Q92692 538 aa9.65□□□□□ -0.86
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KCNC4Q03721 635 aa9.64□□□□□ -0.87
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MTMR2Q13614 643 aa9.64□□□□□ -0.87
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.64□□□□□ -0.87
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPR37L1O60883 481 aa9.63□□□□□ -0.87
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.62□□□□□ -0.87
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF516Q92618 1163 aa9.61□□□□□ -0.87
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FUT2Q10981 343 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TSC1Q92574 1164 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.59□□□□□ -0.87
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 A0A0G2JS52 829 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C6orf229H3BNL8 230 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 WASHC4Q2M389 1173 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 IL21Q9HBE4 155 aa9.58□□□□□ -0.88
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.56□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATP6V1AP38606 617 aa9.55□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.55□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.55□□□□□ -0.88
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR14Q9BWN1 585 aa9.55□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VAC14Q08AM6 782 aa9.54□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.54□□□□□ -0.88
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR7Q8TB68 274 aa9.53□□□□□ -0.88
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.52□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.51□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.51□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZPR1O75312 459 aa9.5□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RETREG3Q86VR2 466 aa9.5□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ALG2Q9H553 416 aa9.5□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NR6A1Q15406 480 aa9.49□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MORN1Q5T089 497 aa9.49□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.49□□□□□ -0.89
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