RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.06■■□□□ 1.28
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOXD1Q16676 465 aa18.93■□□□□ 0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.59■□□□□ 0.57
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.03■□□□□ 0.48
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ADRA2BP18089 450 aa18.02■□□□□ 0.48
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MSH5O43196 834 aa17.5■□□□□ 0.39
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEDQ86YR6 584 aa16.49■□□□□ 0.23
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.39■□□□□ 0.21
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.16■□□□□ 0.18
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KCNA4P22459 653 aa15.97■□□□□ 0.15
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.95■□□□□ 0.14
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.66■□□□□ 0.1
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.61■□□□□ 0.09
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.16■□□□□ 0.02
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.07■□□□□ 0
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RNF39Q9H2S5 420 aa14.99□□□□□ -0.01
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC4A2P04920 1241 aa14.84□□□□□ -0.03
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB22O15209 634 aa14.73□□□□□ -0.05
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.5□□□□□ -0.09
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CAPN15O75808 1086 aa14.42□□□□□ -0.1
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 APLP2Q06481 763 aa14.31□□□□□ -0.12
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DSG3P32926 999 aa14.19□□□□□ -0.14
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ABCB7O75027 752 aa14.14□□□□□ -0.15
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POLA2Q14181 598 aa13.97□□□□□ -0.17
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.96□□□□□ -0.17
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FKBP8Q14318 412 aa13.67□□□□□ -0.22
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FBLN2P98095 1184 aa13.52□□□□□ -0.25
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OSCARQ8IYS5 282 aa13.5□□□□□ -0.25
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC24A1O60721 1099 aa13.38□□□□□ -0.27
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AKT1S1Q96B36 256 aa13.27□□□□□ -0.29
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.26□□□□□ -0.29
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPDYE6P0CI01 402 aa13.26□□□□□ -0.29
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.26□□□□□ -0.29
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.12□□□□□ -0.31
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.08□□□□□ -0.32
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.05□□□□□ -0.32
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PITPNM1O00562 1244 aa13.04□□□□□ -0.32
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CLEC11AQ9Y240 323 aa13□□□□□ -0.33
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEHQ6S545 545 aa12.99□□□□□ -0.33
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FBXO3Q9UK99 471 aa12.97□□□□□ -0.33
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PROM2Q8N271 834 aa12.92□□□□□ -0.34
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.87□□□□□ -0.35
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRR29P0C7W0 189 aa12.8□□□□□ -0.36
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CHADLQ6NUI6 762 aa12.71□□□□□ -0.37
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.71□□□□□ -0.37
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HAX1O00165 279 aa12.58□□□□□ -0.4
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLCB2Q00722 1185 aa12.55□□□□□ -0.4
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CREBZFQ9NS37 354 aa12.55□□□□□ -0.4
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PKD2Q13563 968 aa12.52□□□□□ -0.41
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.5□□□□□ -0.41
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EVX2Q03828 476 aa12.45□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MIER1Q8N108 512 aa12.44□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C19orf67A6NJJ6 358 aa12.4□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KLHL34Q8N239 644 aa12.4□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPOCK2Q92563 424 aa12.4□□□□□ -0.42
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.38□□□□□ -0.43
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLEKHG5O94827 1062 aa12.33□□□□□ -0.44
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms