RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 GmprQ9DCZ1 345 aa4.57□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hoxb3P09026 433 aa4.56□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Irf5P56477 497 aa4.56□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa4.56□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atxn7Q8R4I1 867 aa4.56□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NclP09405 707 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cep120Q7TSG1 988 aa4.55□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mmp16Q9WTR0 607 aa4.55□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wnt7bP28047 349 aa4.54□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa4.54□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm17324Q8C6J8 137 aa4.54□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tll2Q9WVM6 1012 aa4.54□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Capn5O08688 640 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Siah2Q06986 325 aa4.53□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa4.53□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q9CYS6 286 aa4.53□□□□□ -1.68
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dmrtb1A2A9I7 359 aa4.52□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 OatP29758 439 aa4.52□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Agbl2Q8CDK2 862 aa4.52□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 FcrlaQ920A9 352 aa4.52□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa4.51□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa4.51□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 P01644 108 aa4.51□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa4.51□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pacs2Q3V3Q7 862 aa4.51□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kcnv2Q8CFS6 562 aa4.51□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rtn1Q8K0T0 780 aa4.51□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Phox2bO35690 314 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pola2P33611 600 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NppbP40753 121 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp46P62069 366 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lrch3Q8BVU0 778 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Themis2Q91YX0 663 aa4.5□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa4.49□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nek1P51954 1203 aa4.49□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa4.49□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Spns2Q91VM4 549 aa4.49□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Irs1P35569 1233 aa4.48□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cdv3Q4VAA2 281 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 DmknQ6P253 517 aa4.48□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa4.48□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Spaca7Q9D2S4 182 aa4.48□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa4.48□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sox18P43680 377 aa4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fgd1P52734 960 aa4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kmt5bQ3U8K7 883 aa4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dixdc1Q80Y83 711 aa4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trim47Q8C0E3 641 aa4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pcdhb16Q91Y03 802 aa4.47□□□□□ -1.69
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa4.46□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pik3r2O08908 722 aa4.46□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Epb42P49222 691 aa4.46□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Znf511Q6P0X2 227 aa4.46□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Chtf18Q8BIW9 969 aa4.46□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa4.46□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Leng1Q9DB98 261 aa4.46□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Igflr1Q3U4N7 345 aa4.45□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 TbcelQ8C5W3 424 aa4.45□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Speer3W4VSP1 261 aa4.45□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rhox1B1APN4 224 aa4.44□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dsg2O55111 1122 aa4.44□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 VegfbP49766 207 aa4.44□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MetrnlQ8VE43 311 aa4.44□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmem151aQ6GQT5 468 aa4.43□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cts7Q91ZF2 331 aa4.43□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r194J3JS27 296 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Adam19O35674 920 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Msx1P13297 303 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bmp2P21274 394 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm906Q3V0M1 1017 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prr18Q6PAN7 307 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zbtb42Q811H0 420 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Angel2Q8K1C0 544 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PlvapQ91VC4 438 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gdf11Q9Z1W4 405 aa4.42□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PtprnQ60673 979 aa4.41□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam174aQ9D3L0 190 aa4.41□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fut2Q9JL27 347 aa4.41□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Apbb1Q9QXJ1 710 aa4.41□□□□□ -1.7
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 P01645 108 aa4.4□□□□□ -1.71
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 FanccP50652 591 aa4.4□□□□□ -1.71
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dsc3P55850 896 aa4.4□□□□□ -1.71
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Adamts19P59509 1210 aa4.4□□□□□ -1.71
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atf4Q06507 349 aa4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 74.6 ms