Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Dsg2O55111 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Dsg2O55111 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Dsg2O55111 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Dsg2O55111 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Dsg2O55111 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Dsg2O55111 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Dsg2O55111 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Dsg2O55111 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Dsg2O55111 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Dsg2O55111 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Dsg2O55111 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Dsg2O55111 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dsg2O55111 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Dsg2O55111 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Dsg2O55111 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Dsg2O55111 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Dsg2O55111 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Dsg2O55111 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Dsg2O55111 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Dsg2O55111 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Dsg2O55111 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Dsg2O55111 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Dsg2O55111 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Dsg2O55111 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Dsg2O55111 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Dsg2O55111 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Dsg2O55111 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Dsg2O55111 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Dsg2O55111 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Dsg2O55111 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Dsg2O55111 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Dsg2O55111 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Dsg2O55111 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Dsg2O55111 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dsg2O55111 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dsg2O55111 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Dsg2O55111 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dsg2O55111 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dsg2O55111 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Dsg2O55111 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dsg2O55111 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dsg2O55111 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dsg2O55111 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Dsg2O55111 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Dsg2O55111 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dsg2O55111 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Dsg2O55111 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dsg2O55111 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dsg2O55111 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dsg2O55111 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dsg2O55111 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Dsg2O55111 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dsg2O55111 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dsg2O55111 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Dsg2O55111 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dsg2O55111 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dsg2O55111 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dsg2O55111 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dsg2O55111 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dsg2O55111 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Dsg2O55111 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dsg2O55111 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Dsg2O55111 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dsg2O55111 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Dsg2O55111 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dsg2O55111 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Dsg2O55111 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dsg2O55111 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dsg2O55111 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dsg2O55111 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dsg2O55111 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dsg2O55111 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dsg2O55111 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dsg2O55111 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dsg2O55111 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Dsg2O55111 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dsg2O55111 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dsg2O55111 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dsg2O55111 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dsg2O55111 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Dsg2O55111 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dsg2O55111 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dsg2O55111 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Dsg2O55111 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dsg2O55111 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dsg2O55111 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Dsg2O55111 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dsg2O55111 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dsg2O55111 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dsg2O55111 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dsg2O55111 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dsg2O55111 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dsg2O55111 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dsg2O55111 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dsg2O55111 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dsg2O55111 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Dsg2O55111 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dsg2O55111 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dsg2O55111 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms