Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,53■■■■□ 3,76
Dsg2O55111 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Dsg2O55111 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Dsg2O55111 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Dsg2O55111 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,36■■■□□ 2,93
Dsg2O55111 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Dsg2O55111 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Dsg2O55111 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Dsg2O55111 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Dsg2O55111 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Dsg2O55111 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Dsg2O55111 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Dsg2O55111 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Dsg2O55111 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Dsg2O55111 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Dsg2O55111 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Dsg2O55111 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Dsg2O55111 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Dsg2O55111 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Dsg2O55111 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Dsg2O55111 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Dsg2O55111 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Dsg2O55111 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Dsg2O55111 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Dsg2O55111 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Dsg2O55111 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Dsg2O55111 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Dsg2O55111 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Dsg2O55111 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Dsg2O55111 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Dsg2O55111 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Dsg2O55111 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Dsg2O55111 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Dsg2O55111 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Dsg2O55111 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Dsg2O55111 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Dsg2O55111 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Dsg2O55111 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Dsg2O55111 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Dsg2O55111 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Dsg2O55111 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Dsg2O55111 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Dsg2O55111 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Dsg2O55111 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,32
Dsg2O55111 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Dsg2O55111 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Dsg2O55111 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Dsg2O55111 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Dsg2O55111 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Dsg2O55111 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Dsg2O55111 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Dsg2O55111 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Dsg2O55111 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Dsg2O55111 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Dsg2O55111 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Dsg2O55111 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Dsg2O55111 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Dsg2O55111 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Dsg2O55111 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Dsg2O55111 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Dsg2O55111 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Dsg2O55111 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Dsg2O55111 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Dsg2O55111 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Dsg2O55111 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Dsg2O55111 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Dsg2O55111 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Dsg2O55111 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Dsg2O55111 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Dsg2O55111 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Dsg2O55111 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Dsg2O55111 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Dsg2O55111 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Dsg2O55111 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Dsg2O55111 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Dsg2O55111 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Dsg2O55111 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Dsg2O55111 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Dsg2O55111 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Dsg2O55111 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Dsg2O55111 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Dsg2O55111 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Dsg2O55111 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Dsg2O55111 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Dsg2O55111 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Dsg2O55111 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Dsg2O55111 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Dsg2O55111 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Dsg2O55111 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Dsg2O55111 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Dsg2O55111 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Dsg2O55111 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Dsg2O55111 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Dsg2O55111 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Dsg2O55111 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Dsg2O55111 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Dsg2O55111 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Dsg2O55111 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Dsg2O55111 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Dsg2O55111 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms