Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PtprnQ60673 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprnQ60673 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprnQ60673 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprnQ60673 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprnQ60673 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprnQ60673 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprnQ60673 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprnQ60673 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprnQ60673 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprnQ60673 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprnQ60673 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprnQ60673 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprnQ60673 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprnQ60673 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprnQ60673 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprnQ60673 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprnQ60673 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprnQ60673 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprnQ60673 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprnQ60673 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprnQ60673 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PtprnQ60673 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PtprnQ60673 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprnQ60673 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprnQ60673 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprnQ60673 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprnQ60673 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprnQ60673 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprnQ60673 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprnQ60673 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprnQ60673 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprnQ60673 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprnQ60673 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprnQ60673 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprnQ60673 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprnQ60673 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprnQ60673 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprnQ60673 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprnQ60673 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprnQ60673 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprnQ60673 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprnQ60673 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PtprnQ60673 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprnQ60673 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprnQ60673 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprnQ60673 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprnQ60673 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprnQ60673 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtprnQ60673 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprnQ60673 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtprnQ60673 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprnQ60673 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprnQ60673 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprnQ60673 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprnQ60673 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprnQ60673 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprnQ60673 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PtprnQ60673 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprnQ60673 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprnQ60673 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprnQ60673 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprnQ60673 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprnQ60673 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprnQ60673 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprnQ60673 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprnQ60673 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprnQ60673 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprnQ60673 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprnQ60673 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprnQ60673 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprnQ60673 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprnQ60673 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprnQ60673 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprnQ60673 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprnQ60673 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprnQ60673 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprnQ60673 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprnQ60673 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprnQ60673 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprnQ60673 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprnQ60673 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprnQ60673 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprnQ60673 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprnQ60673 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprnQ60673 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprnQ60673 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprnQ60673 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprnQ60673 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprnQ60673 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprnQ60673 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprnQ60673 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprnQ60673 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprnQ60673 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprnQ60673 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprnQ60673 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprnQ60673 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprnQ60673 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprnQ60673 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprnQ60673 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
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