Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Hoxb3P09026 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Hoxb3P09026 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hoxb3P09026 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Hoxb3P09026 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Hoxb3P09026 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hoxb3P09026 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxb3P09026 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxb3P09026 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hoxb3P09026 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxb3P09026 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Hoxb3P09026 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxb3P09026 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Hoxb3P09026 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hoxb3P09026 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Hoxb3P09026 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hoxb3P09026 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hoxb3P09026 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hoxb3P09026 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hoxb3P09026 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Hoxb3P09026 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxb3P09026 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Hoxb3P09026 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hoxb3P09026 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Hoxb3P09026 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxb3P09026 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxb3P09026 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Hoxb3P09026 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hoxb3P09026 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Hoxb3P09026 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Hoxb3P09026 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Hoxb3P09026 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxb3P09026 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hoxb3P09026 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Hoxb3P09026 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxb3P09026 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxb3P09026 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxb3P09026 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxb3P09026 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxb3P09026 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Hoxb3P09026 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Hoxb3P09026 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Hoxb3P09026 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxb3P09026 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxb3P09026 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxb3P09026 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxb3P09026 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxb3P09026 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxb3P09026 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxb3P09026 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hoxb3P09026 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hoxb3P09026 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxb3P09026 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxb3P09026 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxb3P09026 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxb3P09026 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxb3P09026 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxb3P09026 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxb3P09026 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxb3P09026 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxb3P09026 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxb3P09026 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxb3P09026 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxb3P09026 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxb3P09026 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxb3P09026 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxb3P09026 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxb3P09026 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxb3P09026 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxb3P09026 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxb3P09026 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxb3P09026 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxb3P09026 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxb3P09026 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxb3P09026 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxb3P09026 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hoxb3P09026 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxb3P09026 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxb3P09026 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxb3P09026 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxb3P09026 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxb3P09026 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxb3P09026 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxb3P09026 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxb3P09026 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxb3P09026 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxb3P09026 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxb3P09026 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxb3P09026 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hoxb3P09026 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hoxb3P09026 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hoxb3P09026 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxb3P09026 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxb3P09026 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxb3P09026 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxb3P09026 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb3P09026 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb3P09026 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hoxb3P09026 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxb3P09026 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms