RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HypkQ9CR41 129 aa21.22■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 A0A0U1RNP2 1173 aa21.22■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erich4Q3UNU4 136 aa21.22■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 FanciQ8K368 1330 aa21.21■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 St18Q80TY4 1045 aa21.21■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan10Q3URR7 782 aa21.21■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SlkO54988 1233 aa21.21■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf20Q5DTM8 973 aa21.21■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GnpatP98192 678 aa21.2■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa21.2■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim34aQ99PP6 485 aa21.2■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rock1P70335 1354 aa21.19■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa21.19■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sel1lQ9Z2G6 790 aa21.19■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rfx1P48377 963 aa21.19■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bicd2Q921C5 820 aa21.19■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Swt1Q9DBQ9 907 aa21.18■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sycp1Q62209 993 aa21.18■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dapk1Q80YE7 1442 aa21.18■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gnai1B2RSH2 354 aa21.18■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gnai3Q9DC51 354 aa21.18■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EappQ5BU09 281 aa21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdk19Q8BWD8 501 aa21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MsnP26041 577 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Commd10Q8JZY2 202 aa21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cabp2Q9JLK4 216 aa21.17■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erc2Q6PH08 957 aa21.16■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa21.16■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gimap6Q8K349 305 aa21.16■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9D2X8 372 aa21.16■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nol12Q8BG17 217 aa21.15■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp644E9QA22 1323 aa21.15■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TbcaP48428 108 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stard3nlQ9DCI3 235 aa21.15■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gimap5Q8BWF2 308 aa21.14■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep89Q9CZX2 791 aa21.14■□□□□ 0.98
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.14■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ehmt1Q5DW34 1296 aa21.14■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmc1Q8R4P5 757 aa21.14■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ChgaP26339 463 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 VeztQ3ZK22 780 aa21.13■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim34bJ3QNR8 485 aa21.13■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prl7d1P04769 244 aa21.13■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GlmnQ8BZM1 596 aa21.13■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TkfcQ8VC30 578 aa21.12■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map3k13Q1HKZ5 959 aa21.12■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim29Q8R2Q0 587 aa21.12■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zeb2Q9R0G7 1215 aa21.12■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.11■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa21.1■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp48Q3V0C5 1052 aa21.09■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 KinQ8K339 391 aa21.09■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttc5Q99LG4 440 aa21.09■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ggnbp2Q5SV77 696 aa21.08■□□□□ 0.97
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa21.08■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa21.08■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa21.08■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Klc3Q91W40 508 aa21.08■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arid3aQ62431 601 aa21.07■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ZgpatQ8VDM1 511 aa21.07■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Themis2Q91YX0 663 aa21.07■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc178Q8CDV0 866 aa21.06■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa21.06■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cetn4Q8K4K1 168 aa21.05■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pank1Q8K4K6 548 aa21.05■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 A0A1L1SQF0 893 aa21.05■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Btbd11Q6GQW0 1109 aa21.04■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Exoc6bA6H5Z3 810 aa21.04■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Apaf1O88879 1249 aa21.04■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa21.04■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Golim4Q8BXA1 655 aa21.04■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Casq1O09165 405 aa21.03■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim30aP15533 496 aa21.03■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Flad1Q8R123 492 aa21.03■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ralbp1Q62172 648 aa21.03■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfap69Q8BH53 942 aa21.03■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rsph3aQ3UFY4 516 aa21.03■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.02■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ripk4Q9ERK0 786 aa21.02■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Odf2lQ9D478 642 aa21.02■□□□□ 0.96
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hook1Q8BIL5 728 aa21.02■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa21.01■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prdm16A2A935 1275 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.1 ms