RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pank3Q8R2W9 370 aa27,37■■□□□ 1,97
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmf1B9EKI3 1091 aa27,36■■□□□ 1,97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scn4aQ9ER60 1841 aa27,35■■□□□ 1,97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc7Q80TE7 1490 aa27,34■■□□□ 1,97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ift172Q6VH22 1749 aa27,34■■□□□ 1,97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Topaz1E5FYH1 1653 aa27,34■■□□□ 1,97
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP27,34■■□□□ 1,97
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa27,28■■□□□ 1,96
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atf7ipQ7TT18 1306 aa27,1■■□□□ 1,93
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl9Q9D219 1425 aa27,1■■□□□ 1,93
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa27,04■■□□□ 1,92
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q7TT23 1179 aa27,04■■□□□ 1,92
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa27,02■■□□□ 1,92
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plekhg1F6S200 1446 aa26,99■■□□□ 1,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttll13A4Q9F6 804 aa26,99■■□□□ 1,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dcaf11Q91VU6 549 aa26,98■■□□□ 1,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa26,97■■□□□ 1,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Abca14E9Q8F8 1683 aa26,96■■□□□ 1,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa26,96■■□□□ 1,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP26,96■■□□□ 1,91
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa26,95■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plekhh1Q80TI1 1356 aa26,94■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif16bB1AVY7 1312 aa26,94■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa26,94■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psme1P97371 249 aa26,93■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Txndc2Q6P902 515 aa26,93■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26,91■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP26,91■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rwdd1Q9CQK7 243 aa26,9■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nkx1-2P42580 305 aa26,89■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 EspnQ9ET47 871 aa26,89■■□□□ 1,9
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkcshO08795 521 aa26,88■■□□□ 1,89
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nlrp6Q91WS2 869 aa26,87■■□□□ 1,89
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 KdrP35918 1367 aa26,86■■□□□ 1,89
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa26,85■■□□□ 1,89
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nwd1A6H603 1563 aa26,85■■□□□ 1,89
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa26,85■■□□□ 1,89
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asxl2Q8BZ32 1370 aa26,83■■□□□ 1,89
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slit3Q9WVB4 1523 aa26,82■■□□□ 1,88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gsto1O09131 240 aa26,82■■□□□ 1,88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP26,82■■□□□ 1,88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esx1O88933 382 aa26,81■■□□□ 1,88
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppm1gQ61074 542 aa26,79■■□□□ 1,88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mre11Q61216 706 aa26,79■■□□□ 1,88
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ChgaP26339 463 aaKnown RBP26,78■■□□□ 1,88
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