RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa11.69□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp91Q62511 572 aa11.69□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnajc5gQ8C632 165 aa11.69□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cul9Q80TT8 1865 aa11.69□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Skint5A7XUY5 1461 aa11.69□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dapk1Q80YE7 1442 aa11.69□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prex1Q69ZK0 1650 aa11.68□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Polr3aB2RXC6 1390 aa11.68□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q8BT18 775 aa11.67□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RictorQ6QI06 1708 aa11.67□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dot1lQ6XZL8 1540 aa11.67□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PalldQ9ET54 1408 aa11.67□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pik3r4Q8VD65 1358 aa11.67□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyb5rlB1AS42 316 aa11.67□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ino80Q6ZPV2 1559 aa11.65□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Iqgap3F8VQ29 1632 aa11.65□□□□□ -0.54
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Qser1A2BIE1 1698 aa11.64□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bcl11bQ99PV8 884 aa11.64□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa11.64□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PtprmP28828 1452 aa11.63□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa11.62□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CanxP35564 591 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fan1Q69ZT1 1020 aa11.62□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa11.62□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rims1Q99NE5 1463 aa11.62□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa11.61□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AatkQ80YE4 1365 aa11.61□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CenpjQ569L8 1344 aa11.61□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PzpQ61838 1495 aa11.61□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa11.6□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa11.6□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mug2P28666 1451 aa11.6□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa11.6□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plekhg1F6S200 1446 aa11.6□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Srcin1Q9QWI6 1250 aa11.59□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Birc3O08863 600 aa11.59□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Naip7Q9JIB3 1402 aa11.58□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dip2bQ3UH60 1574 aa11.57□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mroh1E0CZ22 1640 aa11.56□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Shq1Q7TMX5 569 aa11.56□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp40Q8BWR4 1235 aa11.56□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mbd5B1AYB6 1498 aa11.55□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abca8aQ8K442 1620 aa11.55□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm6268A2A3U9 297 aa11.55□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tulp4Q9JIL5 1547 aa11.55□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa11.54□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FanciQ8K368 1330 aa11.54□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnh8P59111 1102 aa11.53□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa11.53□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pibf1E9Q6K3 756 aa11.53□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam43aQ8BUP8 424 aa11.53□□□□□ -0.56
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tnnt1O88346 262 aa11.52□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9D9H8 365 aa11.52□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgef28P97433 1693 aa11.52□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spryd3E9Q9B3 442 aa11.52□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dip2aQ8BWT5 1523 aa11.52□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adamts13Q769J6 1426 aa11.52□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rims2Q9EQZ7 1530 aa11.51□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AU022751B1B0V2 589 aa11.51□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dusp27Q148W8 1138 aa11.5□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa11.5□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa11.5□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tshz2Q68FE9 1030 aa11.5□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ncoa1P70365 1447 aa11.5□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Brwd3A2AHJ4 1799 aa11.5□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PplQ9R269 1755 aa11.49□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nphp4P59240 1425 aa11.49□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tnnt2P50752 301 aa11.48□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa11.48□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa11.48□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sirt1Q923E4 737 aa11.47□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa11.47□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plekhg5Q66T02 1073 aa11.47□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rapgef3Q8VCC8 918 aa11.46□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa11.46□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Topaz1E5FYH1 1653 aa11.46□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vsig10D3YX43 558 aa11.46□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clstn1Q9EPL2 979 aa11.46□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HdgfP51859 237 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myo3aQ8K3H5 1613 aa11.45□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrc7Q80TE7 1490 aa11.45□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slit3Q9WVB4 1523 aa11.45□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dcaf11Q91VU6 549 aa11.44□□□□□ -0.58
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mink1Q9JM52 1308 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.7 ms