RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28,42■■■□□ 2,14
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP28,38■■■□□ 2,13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MaddQ80U28 1577 aa28,37■■■□□ 2,13
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 OvosQ3UU35 1456 aa28,36■■■□□ 2,13
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqsec2Q5DU25 1478 aa28,34■■■□□ 2,13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gli2Q0VGT2 1544 aa28,34■■■□□ 2,13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Skint5A7XUY5 1461 aa28,34■■■□□ 2,13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28,33■■■□□ 2,13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP28,33■■■□□ 2,13
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP28,32■■■□□ 2,12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PalldQ9ET54 1408 aa28,32■■■□□ 2,12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 InsrP15208 1372 aa28,32■■■□□ 2,12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf521Q6KAS7 1311 aa28,32■■■□□ 2,12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cnga1P29974 684 aa28,3■■■□□ 2,12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28,3■■■□□ 2,12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tspyl2Q7TQI8 677 aa28,3■■■□□ 2,12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hfm1D3Z4R1 1434 aa28,3■■■□□ 2,12
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc7Q80TE7 1490 aa28,28■■■□□ 2,12
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmc1Q8R4P5 757 aa28,26■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GsdmaQ9EST1 446 aa28,26■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrl1Q80TR1 1466 aa28,25■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28,24■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stag3O70576 1240 aa28,24■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AglF8VPN4 1532 aa28,24■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa28,23■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mre11Q61216 706 aa28,23■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim58Q5NCC9 485 aa28,23■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP28,22■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pank1Q8K4K6 548 aa28,22■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam135bQ9DAI6 1403 aa28,21■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mroh1E0CZ22 1640 aa28,21■■■□□ 2,11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28,19■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28,18■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc37F8VPK0 1563 aa28,18■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptch1Q61115 1434 aa28,18■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc52a2Q9D8F3 450 aa28,18■■■□□ 2,1
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AdgbG3UZ78 1657 aa28,17■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP28,16■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ipo8Q7TMY7 1010 aa28,16■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28,16■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CenpjQ569L8 1344 aa28,16■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 IqubQ8CDK3 788 aa28,15■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28,14■■■□□ 2,1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ak7Q9D2H2 614 aa28,14■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa28,13■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28,12■■■□□ 2,09
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rlbp1Q9Z275 317 aa28,11■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Knl1Q66JQ7 1612 aa28,11■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc183A2AJB1 534 aa28,11■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dip2cE9PWR4 1557 aa28,1■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RereQ80TZ9 1558 aa28,1■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DaxxO35613 739 aa28,1■■■□□ 2,09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adamts7Q68SA9 1657 aa28,09■■■□□ 2,09
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP28,06■■■□□ 2,08
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP28,04■■■□□ 2,08
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP28,03■■■□□ 2,08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cul9Q80TT8 1865 aa28,02■■■□□ 2,08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ksr2Q3UVC0 959 aa28,02■■■□□ 2,08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28,02■■■□□ 2,08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP28■■■□□ 2,07
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Irx3P81067 507 aa28■■■□□ 2,07
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa27,97■■■□□ 2,07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP27,96■■■□□ 2,07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4933416C03RikQ3V063 378 aa27,96■■■□□ 2,07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP27,96■■■□□ 2,07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atl3Q91YH5 541 aa27,93■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dusp27Q148W8 1138 aa27,92■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa27,92■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP27,92■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf541Q0GGX2 1363 aa27,91■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Qser1A2BIE1 1698 aa27,91■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP27,9■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ciz1Q8VEH2 845 aa27,9■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk26Q99JT2 416 aa27,89■■■□□ 2,06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim26Q99PN3 545 aa27,89■■■□□ 2,06
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