RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.42■■■□□ 2.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dbr1Q923B1 550 aa28.39■■■□□ 2.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NudcO35685 332 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MaddQ80U28 1577 aa28.37■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ift172Q6VH22 1749 aa28.36■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CanxP35564 591 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 OvosQ3UU35 1456 aa28.36■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ino80Q6ZPV2 1559 aa28.35■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arid3cA6PWV5 409 aa28.35■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa28.34■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqsec2Q5DU25 1478 aa28.34■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gli2Q0VGT2 1544 aa28.34■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Skint5A7XUY5 1461 aa28.34■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.33■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa28.33■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp10aO54827 1508 aa28.32■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PalldQ9ET54 1408 aa28.32■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 InsrP15208 1372 aa28.32■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf521Q6KAS7 1311 aa28.32■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cnga1P29974 684 aa28.3■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.3■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tspyl2Q7TQI8 677 aa28.3■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hfm1D3Z4R1 1434 aa28.3■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.28■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc7Q80TE7 1490 aa28.28■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AampJ3QN89 436 aa28.27■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppm1gQ61074 542 aa28.27■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnai1Q8C0M8 701 aa28.27■■■□□ 2.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AU022751B1B0V2 589 aa28.26■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P2rx7Q9Z1M0 595 aa28.26■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmc1Q8R4P5 757 aa28.26■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GsdmaQ9EST1 446 aa28.26■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrl1Q80TR1 1466 aa28.25■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stag3O70576 1240 aa28.24■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AglF8VPN4 1532 aa28.24■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa28.23■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mre11Q61216 706 aa28.23■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim58Q5NCC9 485 aa28.23■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pank1Q8K4K6 548 aa28.22■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam135bQ9DAI6 1403 aa28.21■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mroh1E0CZ22 1640 aa28.21■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28.18■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc37F8VPK0 1563 aa28.18■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptch1Q61115 1434 aa28.18■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc52a2Q9D8F3 450 aa28.18■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atxn3Q9CVD2 355 aa28.17■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AdgbG3UZ78 1657 aa28.17■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ipo8Q7TMY7 1010 aa28.16■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.16■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CenpjQ569L8 1344 aa28.16■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 IqubQ8CDK3 788 aa28.15■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28.14■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ak7Q9D2H2 614 aa28.14■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa28.13■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28.12■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim30dE9PWL0 497 aa28.12■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.11■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.11■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc183A2AJB1 534 aa28.11■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.1■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RereQ80TZ9 1558 aa28.1■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DaxxO35613 739 aa28.1■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adamts7Q68SA9 1657 aa28.09■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PrkcshO08795 521 aa28.08■■■□□ 2.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Apaf1O88879 1249 aa28.04■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa28.04■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tsen2Q6P7W5 460 aa28.03■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cul9Q80TT8 1865 aa28.02■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ksr2Q3UVC0 959 aa28.02■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28.02■■■□□ 2.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa28■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Irx3P81067 507 aa28■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Polr3glQ8R0C0 218 aa27.98■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa27.97■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4933416C03RikQ3V063 378 aa27.96■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atl3Q91YH5 541 aa27.93■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dusp27Q148W8 1138 aa27.92■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa27.92■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf541Q0GGX2 1363 aa27.91■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Qser1A2BIE1 1698 aa27.91■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ciz1Q8VEH2 845 aa27.9■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk26Q99JT2 416 aa27.89■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim26Q99PN3 545 aa27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.1 ms