RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025393.13

Smad4-201, Transcript of Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smad4, Length 3,384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Plekhh1Q80TI1 1356 aa25.87■■□□□ 1.73
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
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Smad4-201ENSMUST00000025393 SlkO54988 1233 aa25.81■■□□□ 1.72
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Uggt2E9Q4X2 1504 aa25.73■■□□□ 1.71
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Col17a1Q07563 1470 aa25.7■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ssh1Q76I79 1042 aa25.69■■□□□ 1.7
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Usp19Q3UJD6 1360 aa25.68■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa25.67■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 Fndc1E9Q043 1732 aa25.67■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 Zfp777B9EKF4 885 aa25.66■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 DmtnQ9WV69 405 aa25.66■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa25.65■■□□□ 1.7
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Rabep1O35551 862 aa25.64■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 Trim58Q5NCC9 485 aa25.64■■□□□ 1.7
Smad4-201ENSMUST00000025393 P2rx7Q9Z1M0 595 aa25.64■■□□□ 1.7
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Phf14Q9D4H9 881 aa25.63■■□□□ 1.69
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Prex1Q69ZK0 1650 aa25.62■■□□□ 1.69
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Apaf1O88879 1249 aa25.62■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Nphp4P59240 1425 aa25.61■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Atf7ipQ7TT18 1306 aa25.61■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gli2Q0VGT2 1544 aa25.6■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Stard8Q8K031 1019 aa25.6■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 IqubQ8CDK3 788 aa25.59■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa25.59■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa25.59■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa25.57■■□□□ 1.68
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rims1Q99NE5 1463 aa25.56■■□□□ 1.68
Smad4-201ENSMUST00000025393 Uspl1Q3ULM6 1089 aa25.55■■□□□ 1.68
Smad4-201ENSMUST00000025393 Nutm1Q8BHP2 1126 aa25.55■■□□□ 1.68
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa25.55■■□□□ 1.68
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa25.55■■□□□ 1.68
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
Smad4-201ENSMUST00000025393 Erich6bQ9D4S6 220 aa25.53■■□□□ 1.68
Smad4-201ENSMUST00000025393 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa25.53■■□□□ 1.68
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Aplp1Q03157 653 aa25.53■■□□□ 1.68
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Efcab6Q6P1E8 1516 aa25.46■■□□□ 1.67
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Antxr1Q9CZ52 562 aa25.45■■□□□ 1.67
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