RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE4	YDL105W	APC1	P53886	1748 aa		0.52	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.52	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YAL065C	O13511	128 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-C	P25384	1770 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	NUP170	P38181	1502 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	ATP18	P81450	59 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	SGF11	Q03067	99 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	SCC2	Q04002	1493 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YOR314W	Q12506	109 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TEL1	P38110	2787 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	IRA2	P19158	3079 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TOR1	P35169	2470 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	STT4	P37297	1900 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	HKR1	P41809	1802 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	ULS1	Q08562	1619 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	IML1	P47170	1584 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	ATG2	P53855	1592 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	PAI3	P01094	68 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	QCR9	P22289	66 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	SWM2	P40342	146 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	SDH6	Q3E785	79 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	PMD1	P32634	1753 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	IRA1	P18963	3092 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	UFD4	P33202	1483 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	USO1	P25386	1790 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YNL198C	P40166	100 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	RPC10	P40422	70 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	GCN2	P15442	1659 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	SPO14	P36126	1683 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	IQG1	Q12280	1495 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	SMC4	Q12267	1418 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	ATX1	P38636	73 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	HAP1	P0CE41	1502 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	FKS3	Q04952	1785 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	MYO4	P32492	1471 aa		0.47	□□□□□ -2.33
NSE4	YDL105W	MLP2	P40457	1679 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	BUD3	P25558	1636 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	TIM12	P32830	109 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YNL190W	P53872	204 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	BCK1	Q01389	1478 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	FMP27	Q06179	2628 aa		0.46	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	STU1	P38198	1513 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	PAU7	P39545	55 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	ATP17	Q06405	101 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YBT1	P32386	1661 aa		0.45	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	SSS1	P35179	80 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YBR032W	P38223	100 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	VMR1	P38735	1592 aa		0.44	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	CSF1	Q12150	2958 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	SPI1	P40092	148 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	VTH1	P40438	1549 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	VTH2	P40890	1549 aa		0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YSY6	P38374	65 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	PDR12	Q02785	1511 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	BPH1	P25356	2167 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	OLI1	P61829	76 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YOL131W	Q08270	108 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	HUB1	Q6Q546	73 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NSE4	YDL105W	YBR016W	P38216	128 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NSE4	YDL105W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		0.39	□□□□□ -2.35

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