RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616502.4

EPHB4-210, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHB4, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-210ENST00000616502 ZMPSTE24O75844 475 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CFHP08603 1231 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DSG3P32926 999 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ROR1Q01973 937 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NCOA4Q13772 614 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 EMC2Q15006 297 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 AMHR2Q16671 573 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 LPCAT4Q643R3 524 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TTC13Q8NBP0 860 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.026e-7■■■■□ 23.2
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF862O60290 1169 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DGKIO75912 1065 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TGFB2P61812 414 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CUL2Q13617 745 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GCNAQ96QF7 691 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NEMP1O14524 444 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 AIM2O14862 343 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ABHD2P08910 425 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 IVDP26440 423 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 BST1Q10588 318 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PTPRN2Q92932 1015 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NENFQ9UMX5 172 aa14.92□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF536O15090 1300 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ALOX15BO15296 676 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 STAMBPO95630 424 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 JAK3P52333 1124 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MOGSQ13724 837 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CNBD2Q96M20 576 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 EPAS1Q99814 870 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 APPL1Q9UKG1 709 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CYB561D2O14569 222 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 VTNP04004 478 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF286BP0CG31 522 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ALLCQ8N6M5 410 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ECSITQ9BQ95 431 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KRT7P08729 469 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CCNFP41002 786 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ARHGAP8P85298 464 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MYBPC2Q14324 1141 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DBN1Q16643 649 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 C16orf46Q6P387 395 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 RNF148Q8N7C7 305 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PRPSAP2O60256 369 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PROCP04070 461 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GPC3P51654 580 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 RTP1P59025 263 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MIS12Q9H081 205 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms