RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MICAL2O94851 1124 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ENDOD1O94919 500 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 PTPN4P29074 926 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 LY6KQ17RY6 165 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TMEM132AQ24JP5 1023 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 FAM47CQ5HY64 1035 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ZNF449Q6P9G9 518 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 MIEF2Q96C03 454 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 GPR20Q99678 358 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SDCBP2Q9H190 292 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 BTBD7Q9P203 1132 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CHMP2BQ9UQN3 213 aa29.24■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 HMGCRP04035 888 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CDH8P55286 799 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TFDP2Q14188 446 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 WASHC2DQ5SRD0 308 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CLNKQ7Z7G1 428 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 FAM13CQ8NE31 585 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SLC44A1Q8WWI5 657 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TMEM176AQ96HP8 235 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TUBB6Q9BUF5 446 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TRIM55Q9BYV6 548 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CDT1Q9H211 546 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CYP3A43Q9HB55 503 aa29.23■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 LPXNO60711 386 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CILPO75339 1184 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 DHRS4L1P0CG22 281 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CXCL8P10145 99 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ELK3P41970 407 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 PTK7Q13308 1070 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 LONP2Q86WA8 852 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CEP120Q8N960 986 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 APOPT1Q96IL0 206 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ZNF570Q96NI8 536 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ADPGKQ9BRR6 497 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SYT17Q9BSW7 474 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SLC17A7Q9P2U7 560 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TEX264Q9Y6I9 313 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CHADO15335 359 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ATICP31939 592 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SLC18A2Q05940 514 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 KCNJ11Q14654 390 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TAF5Q15542 800 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 EEF1DP3Q658K8 133 aa29.22■■■□□ 2.27
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UBP1-201ENST00000283628 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 VRTNQ9H8Y1 702 aa29.22■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 WDR91A4D1P6 747 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 NOP56O00567 594 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TGDSO95455 350 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CBX6O95503 412 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CALB2P22676 271 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 NEK3P51956 506 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 CTC1Q2NKJ3 1217 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
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UBP1-201ENST00000283628 TSSK1BQ9BXA7 367 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 SMYD3Q9H7B4 428 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 PNPLA8Q9NP80 782 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA8RI6L899 631 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 M0QYV0 167 aa29.21■■■□□ 2.27
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UBP1-201ENST00000283628 IL1BP01584 269 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 INHBAP08476 426 aa29.21■■■□□ 2.27
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UBP1-201ENST00000283628 GPD2P43304 727 aa29.21■■■□□ 2.27
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UBP1-201ENST00000283628 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 NLRP4Q96MN2 994 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 TWNKQ96RR1 684 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 ELP3Q9H9T3 547 aa29.21■■■□□ 2.27
UBP1-201ENST00000283628 PEX11AO75192 247 aa29.2■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 NFICP08651 508 aa29.2■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 P4HA1P13674 534 aa29.2■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 SLC26A2P50443 739 aa29.2■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 MBTD1Q05BQ5 628 aa29.2■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 TRIM50Q86XT4 487 aa29.2■■■□□ 2.26
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