RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam136aQ9CR98 138 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gdf3Q07104 366 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcolce2Q8R4W6 414 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Oma1Q9D8H7 521 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 EsrraO08580 422 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ptgs2Q05769 604 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rcsd1Q3UZA1 412 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nab1Q61122 486 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Acvrl1Q61288 502 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cyp2c29Q64458 490 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 IqceQ6PCQ0 778 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 March4Q80TE3 409 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam181bQ80VF6 417 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc151Q8BSN3 593 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rfx6Q8C7R7 927 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rmnd1Q8CI78 450 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcdhga10Q91XY9 930 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Haus8Q99L00 373 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PompQ9CQT5 141 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Polr3cQ9D483 533 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rilpl1Q9JJC6 406 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 LipaQ9Z0M5 397 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cyp2t4E9PWV0 503 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DffaO54786 331 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc27a3O88561 667 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gabrb2P63137 512 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fdxacb1Q3UY23 622 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbl2Q64700 1135 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dppa3Q8QZY3 150 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zcchc18Q8VD24 393 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Epn3Q91W69 636 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdia5Q921X9 517 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Psmd6Q99JI4 389 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmco5aQ9D9D5 303 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ubr3Q5U430 1889 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ptar1E9QAB6 424 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TazI7HJS2 263 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Impa1O55023 277 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P01734 135 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 RarbP22605 482 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gsta4P24472 222 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gpr151Q7TSN6 422 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rhpn2Q8BWR8 686 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc159Q8C963 411 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Spag16Q8K450 639 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CpzQ8R4V4 654 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ssxb9A2BI93 185 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sh2d4bA6X942 431 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dynlt1P51807 113 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrrc74bQ14BP6 391 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abi3bpQ59IW6 1179 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr299Q7TS05 330 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Camkk2Q8C078 588 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hdhd5Q91WM2 419 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ChiaQ91XA9 473 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trpc2Q9R244 1172 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mbd1Q9Z2E2 636 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sucla2Q9Z2I9 463 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mical3Q8CJ19 1993 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SnnP61807 88 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q3TQQ9 903 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Elf3Q3UPW2 391 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Clhc1Q5M6W3 596 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdtc1Q80ZK9 677 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atg4cQ811C2 458 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Necab2Q91ZP9 389 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdelr1Q99JH8 212 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ClcnkbQ9WUB6 687 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam171a2A2A699 822 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mllt10O54826 1068 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tnk2O54967 1055 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PolgP54099 1218 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fads6Q80UG1 342 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Taf5Q8C092 801 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smyd2Q8R5A0 433 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BrdtQ91Y44 956 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TfQ921I1 697 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ttc30a1Q99J38 664 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Katnal2Q9D3R6 539 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4930513O06RikQ9D549 161 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmbim4Q9DA39 238 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms