Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI78

Rmnd1, Required for meiotic nuclear division protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmnd1Q8CI78 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Rmnd1Q8CI78 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Rmnd1Q8CI78 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Rmnd1Q8CI78 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Rmnd1Q8CI78 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Rmnd1Q8CI78 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Rmnd1Q8CI78 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Rmnd1Q8CI78 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rmnd1Q8CI78 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Rmnd1Q8CI78 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Rmnd1Q8CI78 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Rmnd1Q8CI78 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Rmnd1Q8CI78 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rmnd1Q8CI78 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Rmnd1Q8CI78 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Rmnd1Q8CI78 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Rmnd1Q8CI78 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rmnd1Q8CI78 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Rmnd1Q8CI78 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Rmnd1Q8CI78 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rmnd1Q8CI78 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rmnd1Q8CI78 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rmnd1Q8CI78 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Rmnd1Q8CI78 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rmnd1Q8CI78 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Rmnd1Q8CI78 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Rmnd1Q8CI78 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Rmnd1Q8CI78 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rmnd1Q8CI78 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Rmnd1Q8CI78 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Rmnd1Q8CI78 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rmnd1Q8CI78 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Rmnd1Q8CI78 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rmnd1Q8CI78 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rmnd1Q8CI78 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Rmnd1Q8CI78 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Rmnd1Q8CI78 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Rmnd1Q8CI78 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Rmnd1Q8CI78 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Rmnd1Q8CI78 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rmnd1Q8CI78 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rmnd1Q8CI78 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rmnd1Q8CI78 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rmnd1Q8CI78 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Rmnd1Q8CI78 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Rmnd1Q8CI78 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rmnd1Q8CI78 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rmnd1Q8CI78 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rmnd1Q8CI78 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rmnd1Q8CI78 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rmnd1Q8CI78 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rmnd1Q8CI78 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rmnd1Q8CI78 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Rmnd1Q8CI78 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Rmnd1Q8CI78 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Rmnd1Q8CI78 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Rmnd1Q8CI78 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Rmnd1Q8CI78 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Rmnd1Q8CI78 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Rmnd1Q8CI78 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Rmnd1Q8CI78 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rmnd1Q8CI78 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rmnd1Q8CI78 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rmnd1Q8CI78 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Rmnd1Q8CI78 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rmnd1Q8CI78 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Rmnd1Q8CI78 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Rmnd1Q8CI78 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Rmnd1Q8CI78 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Rmnd1Q8CI78 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Rmnd1Q8CI78 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Rmnd1Q8CI78 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Rmnd1Q8CI78 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Rmnd1Q8CI78 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Rmnd1Q8CI78 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Rmnd1Q8CI78 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rmnd1Q8CI78 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rmnd1Q8CI78 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rmnd1Q8CI78 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rmnd1Q8CI78 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rmnd1Q8CI78 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rmnd1Q8CI78 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rmnd1Q8CI78 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rmnd1Q8CI78 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rmnd1Q8CI78 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rmnd1Q8CI78 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Rmnd1Q8CI78 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Rmnd1Q8CI78 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rmnd1Q8CI78 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rmnd1Q8CI78 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rmnd1Q8CI78 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rmnd1Q8CI78 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rmnd1Q8CI78 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rmnd1Q8CI78 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Rmnd1Q8CI78 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Rmnd1Q8CI78 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rmnd1Q8CI78 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rmnd1Q8CI78 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rmnd1Q8CI78 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rmnd1Q8CI78 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66,3 ms