Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Gabrb2P63137 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Gabrb2P63137 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Gabrb2P63137 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gabrb2P63137 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gabrb2P63137 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gabrb2P63137 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Gabrb2P63137 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Gabrb2P63137 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gabrb2P63137 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Gabrb2P63137 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Gabrb2P63137 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gabrb2P63137 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Gabrb2P63137 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gabrb2P63137 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gabrb2P63137 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gabrb2P63137 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Gabrb2P63137 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gabrb2P63137 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gabrb2P63137 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gabrb2P63137 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gabrb2P63137 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gabrb2P63137 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gabrb2P63137 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gabrb2P63137 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gabrb2P63137 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Gabrb2P63137 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gabrb2P63137 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gabrb2P63137 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Gabrb2P63137 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gabrb2P63137 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Gabrb2P63137 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gabrb2P63137 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Gabrb2P63137 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gabrb2P63137 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Gabrb2P63137 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gabrb2P63137 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gabrb2P63137 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gabrb2P63137 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gabrb2P63137 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gabrb2P63137 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gabrb2P63137 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gabrb2P63137 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gabrb2P63137 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gabrb2P63137 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gabrb2P63137 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gabrb2P63137 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Gabrb2P63137 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gabrb2P63137 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gabrb2P63137 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gabrb2P63137 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gabrb2P63137 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Gabrb2P63137 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gabrb2P63137 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Gabrb2P63137 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gabrb2P63137 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gabrb2P63137 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gabrb2P63137 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gabrb2P63137 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gabrb2P63137 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gabrb2P63137 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Gabrb2P63137 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gabrb2P63137 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gabrb2P63137 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gabrb2P63137 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gabrb2P63137 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Gabrb2P63137 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gabrb2P63137 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gabrb2P63137 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gabrb2P63137 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Gabrb2P63137 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gabrb2P63137 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gabrb2P63137 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gabrb2P63137 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gabrb2P63137 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gabrb2P63137 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gabrb2P63137 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gabrb2P63137 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gabrb2P63137 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gabrb2P63137 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gabrb2P63137 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gabrb2P63137 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gabrb2P63137 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gabrb2P63137 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gabrb2P63137 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gabrb2P63137 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gabrb2P63137 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gabrb2P63137 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gabrb2P63137 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gabrb2P63137 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gabrb2P63137 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gabrb2P63137 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gabrb2P63137 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gabrb2P63137 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gabrb2P63137 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gabrb2P63137 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gabrb2P63137 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gabrb2P63137 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gabrb2P63137 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gabrb2P63137 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms