Protein–RNA interactions for Protein: A2BI93

Ssxb9, Synovial sarcoma, X member B9, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb9A2BI93 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Ssxb9A2BI93 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Ssxb9A2BI93 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Ssxb9A2BI93 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Ssxb9A2BI93 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Ssxb9A2BI93 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Ssxb9A2BI93 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,54■■■□□ 2,96
Ssxb9A2BI93 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Ssxb9A2BI93 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Ssxb9A2BI93 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Ssxb9A2BI93 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Ssxb9A2BI93 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Ssxb9A2BI93 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
Ssxb9A2BI93 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Ssxb9A2BI93 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Ssxb9A2BI93 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Ssxb9A2BI93 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Ssxb9A2BI93 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Ssxb9A2BI93 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Ssxb9A2BI93 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Ssxb9A2BI93 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Ssxb9A2BI93 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Ssxb9A2BI93 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Ssxb9A2BI93 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Ssxb9A2BI93 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Ssxb9A2BI93 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Ssxb9A2BI93 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Ssxb9A2BI93 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,55■■■□□ 2,64
Ssxb9A2BI93 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ssxb9A2BI93 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Ssxb9A2BI93 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Ssxb9A2BI93 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Ssxb9A2BI93 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Ssxb9A2BI93 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Ssxb9A2BI93 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Ssxb9A2BI93 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ssxb9A2BI93 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ssxb9A2BI93 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Ssxb9A2BI93 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Ssxb9A2BI93 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ssxb9A2BI93 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Ssxb9A2BI93 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Ssxb9A2BI93 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Ssxb9A2BI93 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ssxb9A2BI93 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Ssxb9A2BI93 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Ssxb9A2BI93 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Ssxb9A2BI93 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ssxb9A2BI93 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ssxb9A2BI93 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ssxb9A2BI93 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ssxb9A2BI93 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ssxb9A2BI93 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ssxb9A2BI93 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ssxb9A2BI93 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ssxb9A2BI93 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Ssxb9A2BI93 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ssxb9A2BI93 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ssxb9A2BI93 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ssxb9A2BI93 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Ssxb9A2BI93 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ssxb9A2BI93 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ssxb9A2BI93 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ssxb9A2BI93 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ssxb9A2BI93 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ssxb9A2BI93 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ssxb9A2BI93 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ssxb9A2BI93 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Ssxb9A2BI93 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ssxb9A2BI93 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ssxb9A2BI93 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,32
Ssxb9A2BI93 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Ssxb9A2BI93 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Ssxb9A2BI93 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ssxb9A2BI93 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Ssxb9A2BI93 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ssxb9A2BI93 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ssxb9A2BI93 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ssxb9A2BI93 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Ssxb9A2BI93 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ssxb9A2BI93 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Ssxb9A2BI93 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ssxb9A2BI93 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ssxb9A2BI93 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ssxb9A2BI93 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ssxb9A2BI93 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ssxb9A2BI93 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ssxb9A2BI93 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ssxb9A2BI93 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
Ssxb9A2BI93 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Ssxb9A2BI93 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ssxb9A2BI93 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ssxb9A2BI93 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ssxb9A2BI93 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ssxb9A2BI93 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ssxb9A2BI93 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ssxb9A2BI93 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ssxb9A2BI93 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ssxb9A2BI93 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ssxb9A2BI93 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52,7 ms