RNA–Protein interactions for RNA: YJL139C

YUR1, Transcript of Mannosyltransferase involved in protein N-glycosylation, yeast

Gene YUR1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YUR1	YJL139C	YIA6	P40556	373 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YDR029W	Q12111	104 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YHR213W	P0CI67	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	UBC5	P15732	148 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	SPI1	P40092	148 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YMR181C	Q03231	154 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YDR114C	Q04597	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	SMP1	P38128	452 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	AIM11	P87275	137 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YMR317W	Q04893	1140 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	CSF1	Q12150	2958 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	INO2	P26798	304 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	TOM6	P33448	61 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	RRT1	P38192	103 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YER084W	P40057	128 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	AIM34	Q03673	198 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	IMP2	P46972	177 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YDR209C	Q03480	137 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	IRA2	P19158	3079 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YUR1	YJL139C	CCW14	O13547	238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	LDB16	P25587	256 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	MRPL39	P36533	70 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	MTC6	P38849	526 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	AIM19	P40502	157 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	PIR5	P46999	287 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	SBH1	P52870	82 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	IRC23	Q08416	157 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	PBA1	Q05778	276 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	SHH4	Q06236	168 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	CRC1	Q12289	327 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	PRM7	Q12459	698 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	ATP15	P21306	62 aa		5	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YKR045C	P36138	183 aa		5	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	GLE2	P40066	365 aa		5	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	BLM10	P43583	2143 aa		5	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YCR050C	P25630	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	MRPS12	P53732	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	RNH203	Q12338	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	EMC6	Q12431	108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	ERG28	P40030	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	SIP18	P50263	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YNL190W	P53872	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	MPC2	P38857	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	PEX17	P40155	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	SIM1	P40472	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	DCV1	P43595	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	YNL234W	P53857	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YUR1	YJL139C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	YSY6	P38374	65 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	HUR1	P45820	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	IRA1	P18963	3092 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	SVP26	P38869	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	TRP1	P00912	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	RPL39	P04650	51 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	RRT13	P40042	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	ALG13	P53178	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	MSA2	P36157	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	YJR146W	P47174	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	YER187W	P40102	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	IES6	P32617	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	SHU1	P38751	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YUR1	YJL139C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YGR219W	P53307	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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