RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA17Q96L03 361 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 NOX5Q96PH1 765 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNK16Q96T55 309 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ISCUQ9H1K1 167 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 TLE6Q9H808 572 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 DPP7Q9UHL4 492 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 F8VP50 259 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 NDUFA10O95299 355 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 GRIK1P39086 918 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP3K7CLP57077 242 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PDCLQ13371 301 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 NAA35Q5VZE5 725 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGZQ86VD9 579 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 HHLA1C9JL84 531 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 RTN2O75298 545 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MMP8P22894 467 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 CDR1P51861 262 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNC3Q14003 757 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PMF1Q6P1K2 205 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM110Q86TL2 294 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 TULP2O00295 520 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PRRG1O14668 218 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ACADSBP45954 432 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB41Q5JT25 222 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 YIPF1Q9Y548 306 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 TNFRSF10BO14763 440 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PER2O15055 1255 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 GABRB2P47870 512 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX16P57768 344 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MTF1Q14872 753 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 DDR2Q16832 855 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 CPXM1Q96SM3 734 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MIS12Q9H081 205 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF263O14978 683 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PAPLNO95428 1278 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ATF6P18850 670 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXA9P31269 272 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ALDH1A3P47895 512 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 NRIP1P48552 1158 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PLD1Q13393 1074 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 LIN9Q5TKA1 542 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MON1BQ7L1V2 547 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 ERICH1Q86X53 443 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 IL37Q9NZH6 218 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 MYH10P35580 1976 aa23.2■■□□□ 1.31
PACSIN3-205ENST00000528462 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 C8AP07357 584 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA31D3P0C874 917 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 PTP4A2Q12974 167 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 ADGRE1Q14246 886 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 SPA17Q15506 151 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 COMMD8Q9NX08 183 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 USP3Q9Y6I4 520 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 PLXNA3P51805 1871 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 GABBR2O75899 941 aa23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3-205ENST00000528462 EPCAMP16422 314 aa23.19■■□□□ 1.3
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