RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W ATP20Q12233 115 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W EMC6Q12431 108 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RRT15Q3E811 62 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W UFD4P33202 1483 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W TY3B-GQ99315 1547 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W PAU21P0CE86 164 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W PAU22P0CE87 164 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YHR213WP0CI67 198 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W FYV5P25585 152 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RPB7P34087 171 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W UMP1P38293 148 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W NCA3P46955 337 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W DAD1Q12248 94 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W SCS22Q6Q595 175 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W MYO1P08964 1928 aa3.1□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W CDC25P04821 1589 aa3.09□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W QCR10P37299 77 aa3.09□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YEL073CP39974 107 aa3.09□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W SMX2P40204 77 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YMR295CQ03559 197 aa3.09□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.09□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W DNF1P32660 1571 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W TY4B-HP0C2J7 1802 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W FZF1P32805 299 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W RRT1P38192 103 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W CTR2P38865 189 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YER187WP40102 141 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W SOM1Q05676 74 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W SRL1Q08673 210 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YOR015WQ12169 119 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W UBR1P19812 1950 aa3.08□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W ECM29P38737 1868 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MDM35O60200 86 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YHL005CP38752 130 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W TVP23P38962 199 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YNL217WP40152 326 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W IGO1P53897 168 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MRPS16Q02608 121 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W GRX5Q02784 150 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YMR244WQ04018 355 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YOL029CQ08187 201 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YFL041W-AQ3E817 63 aa3.07□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YBR292CP38357 123 aa3.06□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W RSM18P40033 138 aa3.06□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YGL118CP53132 145 aa3.06□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YPL247CQ12523 523 aa3.06□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YLR111WQ12528 110 aa3.06□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MRP17P28778 131 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W PTH1P38876 190 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YFL067WP43537 175 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MIC27P50945 234 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W CRH1P53301 507 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W COX12Q01519 83 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W ICY1Q04329 127 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YDR115WQ04598 105 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YDL157CQ12082 118 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W PAN1P32521 1480 aa3.04□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W PAU15P40585 124 aa3.04□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W TVP15Q03860 143 aa3.04□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YPL261CQ08976 102 aa3.04□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.04□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W PAU2P32612 120 aa3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YHR125WP38831 101 aa3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W RRT13P40042 185 aa3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W YIL054WP40524 105 aa3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W BNS1P50084 137 aa3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MPC3P53311 146 aa3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W MET31Q03081 177 aa3.03□□□□□ -1.92
YPT53YNL093W PAU19P0CE85 124 aa3.02□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W PAU3P25610 124 aa3.02□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W ICS3P47034 131 aa3.02□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W BOL2P53082 120 aa3.02□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W API2Q04413 109 aa3.02□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W TY4B-JP47024 1803 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W SOD1P00445 154 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W PAU12P53343 120 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W PBA1Q05778 276 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W IRC19Q07843 230 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W AYT1Q12226 474 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W YOR381W-AQ3E804 55 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W OST5Q92316 86 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W FKS3Q04952 1785 aa3.01□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YPT53YNL093W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
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