RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	YGL185C	P53100	379 aa		2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	SDS23	P53172	527 aa		2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YMR141C	P40211	102 aa		2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	PAU4	P53427	120 aa		2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	APS2	Q00381	147 aa		2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RUB1	Q03919	77 aa		2.33	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CYC7	P00045	113 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	AME1	P38313	324 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YIL024C	P40543	189 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	SNN1	P48232	102 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	PHO23	P50947	330 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YGL149W	P53116	101 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YLR042C	Q07990	161 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CYB5	P40312	120 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	MOG1	P47123	218 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	EOS1	P53938	366 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	SHU1	P38751	150 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	PAU7	P39545	55 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YGR269W	P40326	108 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	PAU5	P43575	122 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	UBC12	P52491	188 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	AVO2	Q04749	426 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	LCL2	Q08045	131 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CUP2	P15315	225 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YCR025C	P25352	136 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	SCM4	P32564	187 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	LCL1	Q02786	101 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	SRB6	P32570	121 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	2.31	□□□□□ -2.04	not detected
STE6	YKL209C	ATX2	Q12067	313 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	ZRT1	P32804	376 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	IMP2	P46972	177 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	ERV14	P53173	138 aa		2.31	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CWC27	Q02770	301 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	LDS1	P31379	325 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RRT13	P40042	185 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	TIM21	P53220	239 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	HHO1	P53551	258 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	DPP1	Q05521	289 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CCW12	Q12127	133 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	ENV10	Q99382	181 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		2.3	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	MRPL44	P19956	98 aa		2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YAL064W	P39711	94 aa		2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CWP2	P43497	92 aa		2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	GIM5	Q04493	163 aa		2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	SEC59	P20048	519 aa		2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	MRPS16	Q02608	121 aa		2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YKL070W	P36087	169 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	PGD1	P40356	397 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	CDC43	P18898	376 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	AGA1	P32323	725 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	DCV1	P43595	202 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	GLO1	P50107	326 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	FYV7	Q12247	151 aa		2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
STE6	YKL209C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	AHT1	P29589	182 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	KRE9	P39005	276 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	UIP3	P39547	235 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	NSE4	P43124	402 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	BRP1	P53194	125 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	STF1	P01098	86 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	GPI19	Q04082	140 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	YMR320W	Q04897	101 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.27	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	VAR1	P02381	398 aa		2.26	□□□□□ -2.05
STE6	YKL209C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05

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