RNA–Protein interactions for RNA: YAL058W

CNE1, Transcript of Calnexin, yeast

Gene CNE1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNE1	YAL058W	COX16	P47081	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	ABM1	P47146	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	SNA4	Q07549	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	FCY1	Q12178	158 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	JID1	Q12350	301 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
CNE1	YAL058W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	GPI19	Q04082	140 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNE1	YAL058W	PAI3	P01094	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	APS1	P35181	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YIP1	P53039	248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	DIF1	O13577	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	CYC7	P00045	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	MST27	P53176	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YGR045C	P53229	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YML079W	Q03629	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	GEP3	Q08622	556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	RPB9	P27999	122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	IES6	P32617	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YKL044W	P36092	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YER076C	P40049	302 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	ATG39	Q06159	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	DGA1	Q08650	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	CCW14	O13547	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	ANB1	P19211	157 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	GPI18	P38211	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	CDC43	P18898	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YHR140W	P38842	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	MST28	P39552	234 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YPL073C	P40323	161 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	MGR2	Q02889	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	TIM22	Q12328	207 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	CMC1	P36064	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	LCB3	P47013	409 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YGR025W	P53216	100 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	UBC7	Q02159	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	VMA11	P32842	164 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	SNF11	P38956	169 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	PFY1	P07274	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YEL067C	P39978	195 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	SPI1	P40092	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	ATP23	P53722	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	SCW10	Q04951	389 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CNE1	YAL058W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	ELC1	Q03071	99 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	MSA1	Q08471	629 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YKL070W	P36087	169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YKR041W	P36134	250 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	POR2	P40478	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YNR077C	P53758	84 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	DIA1	P54005	336 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	PHO85	P17157	305 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	AGA1	P32323	725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YFR057W	P43625	151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	TOS6	P48560	102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YGR219W	P53307	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YML122C	Q03207	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	OXA1	P39952	402 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected

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