RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 USP3Q9Y6I4 520 aa8.66□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 PI4KAP42356 2102 aa8.66□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.66□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 SYN3O14994 580 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 CHADO15335 359 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 MARCH6O60337 910 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 PFKFB2O60825 505 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 PROS1P07225 676 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 CYP11B2P19099 503 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 PROZP22891 400 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 KRT2P35908 639 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 CYP4F8P98187 520 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 SPAG1Q07617 926 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 CEP68Q76N32 757 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 NECAB1Q8N987 351 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 STKLD1Q8NE28 680 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 DEPTORQ8TB45 409 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 GAB3Q8WWW8 586 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 HPS4Q9NQG7 708 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 ASAH2Q9NR71 780 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 RNF112Q9ULX5 631 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 BPTFQ12830 3046 aa8.65□□□□□ -1.02
RD3L-201ENST00000557640 ZNF197O14709 1029 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 DCLK1O15075 740 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ZNF806P0C7X5 589 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CPB1P15086 417 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 KCNE1P15382 129 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ATF6P18850 670 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 HOXA6P31267 233 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ELF1P32519 619 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MCM7P33993 719 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TXLNAP40222 546 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MPLP40238 635 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 LRRC32Q14392 662 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TPGS2Q68CL5 300 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 IL31Q6EBC2 164 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ZNF280DQ6N043 979 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 KCNK18Q7Z418 384 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 GATA6Q92908 595 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 HHIPQ96QV1 700 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CCL26Q9Y258 94 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ADAMTS20P59510 1910 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.64□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 LNP1A1A4G5 178 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MTMR11A4FU01 709 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 M0QZQ0 153 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TRAPPC3O43617 180 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CXCL8P10145 99 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MCM4P33991 863 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CNR2P34972 360 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 NPTX2P47972 431 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 DUSP4Q13115 394 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 PPP2R5DQ14738 602 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 PLK5Q496M5 336 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.63□□□□□ -1.03
RD3L-201ENST00000557640 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.63□□□□□ -1.03
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