RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 EGFRP00533 1210 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SRGNP10124 158 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 GEMP55040 296 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 STX4Q12846 297 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PCSK7Q16549 785 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 KRT74Q7RTS7 529 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 KLHL3Q9UH77 587 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 E9PBE3 544 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 VPS26AO75436 327 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 HNMTP50135 292 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CD302Q8IX05 232 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TMEM237Q96Q45 408 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 WDCPQ9H6R7 721 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TET3O43151 1660 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TMEM114B3SHH9 223 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 H7C1W4 665 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 HBP1O60381 514 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 RHOBTB3O94955 611 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 F9P00740 461 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 LRG1P02750 347 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ITGAXP20702 1163 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TGM2P21980 687 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ITIH4Q14624 930 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 VAV3Q9UKW4 847 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 EXTL3O43909 919 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 STAG3L1P0CL83 205 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 GALCP54803 685 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CDH18Q13634 790 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PROSER3Q2NL68 480 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SVOPQ8N4V2 548 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 IPMKQ8NFU5 416 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 JADE3Q92613 823 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 GANQ9H2C0 597 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SERHLQ9NQF3 203 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 RPS6KA5O75582 802 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 UCHL3P15374 230 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CDC16Q13042 620 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PTPN21Q16825 1174 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ARMC3Q5W041 872 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TRIM9Q9C026 710 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SLITRK2Q9H156 845 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 VTA1Q9NP79 307 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 COMMD8Q9NX08 183 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DSEQ9UL01 958 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ESYT3A0FGR9 886 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TMEM120BA0PK00 339 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MEI4A8MW99 385 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 NCAM2O15394 837 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 C21orf2O43822 256 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CLTBP09497 229 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 ERVK-10P10266 1014 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 YWHAQP27348 245 aa6.91□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.91□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CPDO75976 1380 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CRTAMO95727 393 aa6.91□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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