RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391183.1

RNU6-1197P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1197, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1197P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 UBA7P41226 1012 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 VIPR2P41587 438 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KCNQ1P51787 676 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GALNT2Q10471 571 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ADAM15Q13444 863 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ATP1A4Q13733 1029 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 BECN1Q14457 450 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KCNAB1Q14722 419 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GRM4Q14833 912 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RTP5Q14D33 572 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GPR68Q15743 365 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PLA1AQ53H76 456 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MFSD14BQ5SR56 506 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ADGRF1Q5T601 910 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 NAA35Q5VZE5 725 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TRIM68Q6AZZ1 485 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ANO7Q6IWH7 933 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MFSD5Q6N075 450 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SLC23A3Q6PIS1 610 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SYT13Q7L8C5 426 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 WFDC3Q8IUB2 231 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RTKN2Q8IZC4 609 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FAM46DQ8NEK8 389 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CPT1BQ92523 772 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ATP2A3Q93084 1043 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MRI1Q9BV20 369 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PCDH18Q9HCL0 1135 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MRGBPQ9NV56 204 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KCND3Q9UK17 655 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CROTQ9UKG9 612 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 IRS2Q9Y4H2 1338 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZMYM3Q14202 1370 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 H3BNC9 293 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 H7C0S8 307 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 J3KTA2 159 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 AP3D1O14617 1153 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 STX16O14662 325 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TOX4O94842 621 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HAUS5O94927 633 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MLYCDO95822 493 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HMGCRP04035 888 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 APOA4P06727 396 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ARP10275 920 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ALAS1P13196 640 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 SERPINA4P29622 427 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MAPK4P31152 587 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PGM1P36871 562 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CASRP41180 1078 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ETV4P43268 484 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MEOX1P50221 254 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CDK7P50613 346 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 PTTG1IPP53801 180 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ITGA1P56199 1179 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 YBX1P67809 324 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TCF15Q12870 199 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CDC16Q13042 620 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 DUSP8Q13202 625 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MAMLD1Q13495 774 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ACVR2BQ13705 512 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 WTAPQ15007 396 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 HECTD3Q5T447 861 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 MANEALQ5VSG8 457 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZNF529Q6P280 563 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 LRRC8DQ7L1W4 858 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1197P-201ENST00000391183 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms