RNA–Protein interactions for RNA: YMR213W

CEF1, Transcript of Essential splicing factor, yeast

Gene CEF1, Length 1,773 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CEF1	YMR213W	RLM1	Q12224	676 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	BET2	P20133	325 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YCR085W	P25650	117 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	SFT2	P38166	215 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	MRX11	Q03079	207 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	MSA1	Q08471	629 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	SUT2	Q12286	268 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	CAX4	P53223	239 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	FCY1	Q12178	158 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	LCB3	P47013	409 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	MIM1	Q08176	113 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YOR186W	Q08560	144 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	MID2	P36027	376 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YHR180W	P38868	163 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	PAU7	P39545	55 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	GON7	P46984	123 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	SBH1	P52870	82 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	HPF1	Q05164	967 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	RAF1	Q06891	181 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YPS3	Q12303	508 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	FUB1	P25659	250 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	NRG2	P38082	220 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	CSH1	P38287	376 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YHR173C	P38864	112 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YOR343C	Q12484	108 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YPS1	P32329	569 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	MRPS5	P33759	307 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	GCS1	P35197	352 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	LST8	P41318	303 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YDR042C	Q03205	200 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YMR103C	Q04436	120 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	RRG8	Q06109	277 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	DAD1	Q12248	94 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	FZF1	P32805	299 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	SWD3	P38123	315 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	UBC11	P52492	156 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	AIM11	P87275	137 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	YOL118C	Q08259	102 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CEF1	YMR213W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	HUA1	P40325	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	ALG13	P53178	202 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	MRPL19	P53875	158 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	NCE101	Q02820	53 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	UPS1	Q05776	175 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YFR054C	P43622	192 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	GPI18	P38211	433 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YHL042W	P38729	150 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YHR140W	P38842	239 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	FIP1	P45976	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	TOM7	P53507	60 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	HST4	P53688	370 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	TIM10	P87108	93 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	IRC19	Q07843	230 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	MRS3	P10566	314 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	IMP1	P28627	190 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YFR057W	P43625	151 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	VPS55	P47111	140 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	COX12	Q01519	83 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	API2	Q04413	109 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YHR139C-A	O13536	103 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YKL070W	P36087	169 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	DSE2	P38844	325 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	PET8	P38921	284 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	TVP23	P38962	199 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YDR102C	Q03864	110 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YHP1	Q04116	353 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YCR006C	P25350	157 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	INO2	P26798	304 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	TOM6	P33448	61 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	CIS3	P47001	227 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	UBC13	P52490	153 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YLR042C	Q07990	161 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEF1	YMR213W	YCR050C	P25630	102 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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