RNA–Protein interactions for RNA: YMR071C

TVP18, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP18, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP18	YMR071C	NDD1	Q08887	554 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YOR385W	Q08909	290 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YDL157C	Q12082	118 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YDL211C	Q12121	372 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	ATG40	Q99325	256 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	MRPS9	P38120	278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	SWD3	P38123	315 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	HSP10	P38910	106 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	KNH1	P50112	268 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	PCP1	P53259	346 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	COX12	Q01519	83 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YMR252C	Q04814	134 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	ELP6	Q04868	273 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
TVP18	YMR071C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	CSH1	P38287	376 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YHL042W	P38729	150 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YER134C	P40081	178 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	PEP8	P40335	379 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	PAU5	P43575	122 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	TOS2	P50078	622 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	TPC1	P53257	314 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	GPI19	Q04082	140 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YLR281C	Q05863	155 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	HRT1	Q08273	121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YOR015W	Q12169	119 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	DAD1	Q12248	94 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	EMC6	Q12431	108 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	CSR2	Q12734	1121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YBT1	P32386	1661 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	TY4B-J	P47024	1803 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	VMR1	P38735	1592 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
TVP18	YMR071C	YND1	P40009	630 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	SPO73	P40031	143 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	PIR5	P46999	287 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	MIC27	P50945	234 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	GRX5	Q02784	150 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RIM9	Q04734	239 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	SPS100	P13130	326 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	LDB16	P25587	256 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	ASK1	P35734	292 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	OM14	P38325	134 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YBR292C	P38357	123 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	TDA2	P40045	126 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	HUR1	P45820	110 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	ATP19	P81451	68 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	HAL1	Q01766	294 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YDR042C	Q03205	200 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YLR296W	Q05898	108 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	ATG41	Q12048	136 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	PCL9	Q12477	304 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	ODC2	Q99297	307 aa		2.73	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	BET1	P22804	142 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YKL097C	P34245	136 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YCR041W	P37265	110 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	ECM29	P38737	1868 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YFR035C	P43608	114 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YMR254C	Q04838	102 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	MSA1	Q08471	629 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TVP18	YMR071C	YCR043C	P25361	127 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TVP18	YMR071C	UMP1	P38293	148 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TVP18	YMR071C	YAR068W	P39564	161 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TVP18	YMR071C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
TVP18	YMR071C	PGU1	P47180	361 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TVP18	YMR071C	YGL262W	P53054	175 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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