RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TSPAN4O14817 238 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAJB5O75953 348 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCNDBP1O95273 360 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 KNG1P01042 644 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 POMCP01189 267 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANXA6P08133 673 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CKBP12277 381 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRPAP1P30533 357 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 GALNSP34059 522 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 THBS2P35442 1172 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PGM1P36871 562 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHRNA4P43681 627 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PHKA1P46020 1223 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALDH1A3P47895 512 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 GZMKP49863 264 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCR5P51681 352 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 DLG4P78352 724 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ROR1Q01973 937 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PIGFQ07326 219 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAM9Q13443 819 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ERV3-1Q14264 604 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 WTAPQ15007 396 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 IQCB1Q15051 598 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLCB4Q15147 1175 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 MSMPQ1L6U9 139 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRIM60Q495X7 471 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 AFMIDQ63HM1 303 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANO7Q6IWH7 933 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 KYQ8NBH2 561 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR5M3Q8NGP4 307 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF125Q96EQ8 232 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 FEM1CQ96JP0 617 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRI1Q9BV20 369 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 AGXT2Q9BYV1 514 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHODLQ9H9P2 273 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ING3Q9NXR8 418 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL14Q9P2G3 628 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBPJLQ9UBG7 517 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM184BQ9ULE4 1060 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PASKQ96RG2 1323 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR2W5A6NFC9 320 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 M0QYG6 137 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 AP3D1O14617 1153 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 RGS10O43665 173 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 COBLO75128 1261 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PIAS2O75928 621 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TOX4O94842 621 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SASH1O94885 1247 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL18O94889 574 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SGPL1O95470 568 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 BAG2O95816 211 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 APOA4P06727 396 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 C8BP07358 591 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 FPR1P21462 350 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 SERPINA4P29622 427 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXD13P35453 343 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPD2P43304 727 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 STAT5BP51692 787 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNLIPRP1P54315 467 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRKAA2P54646 552 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 NPEPPSP55786 919 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITGA1P56199 1179 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLRN1P58418 232 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRT83P78385 493 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TCF15Q12870 199 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPS1Q13098 491 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHAF1BQ13112 559 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 MPP3Q13368 585 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-928P-201ENST00000516876 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms