RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514951.5

SMN1-209, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMN1, Length 1,308 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-209ENST00000514951 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FANCCQ00597 558 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ZNF394Q53GI3 561 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 RTL10Q7L3V2 364 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 GJD3Q8N144 294 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ABCB6Q9NP58 842 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CD207Q9UJ71 328 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CDH22Q9UJ99 828 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 YIPF1Q9Y548 306 aa20.38■□□□□ 0.85
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SMN1-209ENST00000514951 NOL4O94818 638 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SERPINC1P01008 464 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CYP2F1P24903 491 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 HOXA9P31269 272 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SYCP1Q15431 976 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 IQCEQ6IPM2 695 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 C12orf29Q8N999 325 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 GANQ9H2C0 597 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CD320Q9NPF0 282 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ZNF132P52740 706 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 MFAP3P55082 362 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CYP27A1Q02318 531 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 PTPN21Q16825 1174 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 TMEM270Q6UE05 265 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FUKQ8N0W3 1084 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FAM81BQ96LP2 452 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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SMN1-209ENST00000514951 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CLDN5O00501 218 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 EPHB6O15197 1021 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CCL16O15467 120 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 POU2F2P09086 479 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CCDC130P13994 396 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 UCHL3P15374 230 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ATF6P18850 670 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 TWF1Q12792 350 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 NR1I3Q14994 352 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 GPR149Q86SP6 731 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SHC3Q92529 594 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 RBSNQ9H1K0 784 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 NOTCH4Q99466 2003 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 MYH10P35580 1976 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 BDNFP23560 247 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 MAGEA11P43364 429 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 GPR15P49685 360 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CACNA2D1P54289 1103 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 ITIH3Q06033 890 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 FAM35AQ86V20 835 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 SUSD6Q92537 303 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 GPR88Q9GZN0 384 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 CEP72Q9P209 647 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-209ENST00000514951 MBTPS2O43462 519 aa20.33■□□□□ 0.85
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