RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502575.1

PDE4D-209, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-209ENST00000502575 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 SPECC1Q5M775 1068 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 USP49Q70CQ1 688 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 GPBP1Q86WP2 473 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 FLCNQ8NFG4 579 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 GPR152Q8TDT2 470 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 ACAP3Q96P50 834 aa9.51□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 TCHPQ9BT92 498 aa9.51□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 CNTN3Q9P232 1028 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 POLIQ9UNA4 740 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 CLIC4Q9Y696 253 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 TISP43B9A030 160 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 PI15O43692 258 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 FAM189A1O60320 539 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 TOM1L1O75674 476 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 LAMP2P13473 410 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 KCNE1P15382 129 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 SCNN1AP37088 669 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 MCM2P49736 904 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 GUCY2FP51841 1108 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 STRN3Q13033 797 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 HTR4Q13639 388 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 RAB33AQ14088 237 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 LIN9Q5TKA1 542 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 XKR5Q6UX68 686 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 ITFG1Q8TB96 612 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 ING5Q8WYH8 240 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 RAD54LQ92698 747 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 STAMQ92783 540 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 FGF14Q92915 247 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 EPSTI1Q96J88 318 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 UROC1Q96N76 676 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 TIPINQ9BVW5 301 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 DPP7Q9UHL4 492 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 K7ENM7 598 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 C1RP00736 705 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 UBA7P41226 1012 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 20.9
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PDE4D-209ENST00000502575 ARPP19P56211 112 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-209ENST00000502575 MCL1Q07820 350 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 PARM1Q6UWI2 310 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-209ENST00000502575 FAM13AO94988 1023 aa9.48□□□□□ -0.89
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