RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, human

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC13A3-208	ENST00000464518	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
SLC13A3-208	ENST00000464518	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SLC13A3-208	ENST00000464518	FRY	Q5TBA9	3013 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518		E9PMD0	336 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PIR	O00625	290 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM189A1	O60320	539 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PIGR	P01833	764 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARSA	P15289	507 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	IRX4	P78413	519 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	USP4	Q13107	963 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF77	Q15935	545 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPACA7	Q96KW9	195 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ASB7	Q9H672	318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ATRX	P46100	2492 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PFKL	P17858	780 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PRPH	P41219	470 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TNFSF9	P41273	254 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	IFNAR2	P48551	515 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PDE6C	P51160	858 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPAG1	Q07617	926 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	CUL4A	Q13619	759 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	EML3	Q32P44	896 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	HYI	Q5T013	277 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PIP4P1	Q86T03	277 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	BICD1	Q96G01	975 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	MYH11	P35749	1972 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NOL4	O94818	638 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NFATC1	O95644	943 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TAF6	P49848	677 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	LIG4	P49917	911 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NUCB2	P80303	420 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	CRY1	Q16526	586 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	CEP76	Q8TAP6	659 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	CYB561D2	O14569	222 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPEF2	O14830	753 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	JAK2	O60674	1132 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	DTNB	O60941	627 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	TADA3	O75528	432 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	CAPNS1	P04632	268 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SLC13A3-208	ENST00000464518	P2RY2	P41231	377 aa		13.61	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms